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龙图腾网恭喜浙江工业大学申请的专利基于后处理方式的蛋白质与ATP绑定残基预测方法获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN114121143B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-05-09发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202111254444.4，技术领域涉及：G16B5/00；该发明授权基于后处理方式的蛋白质与ATP绑定残基预测方法是由胡俊;贾宁欣;殷文杰;董明;董世建;张贵军设计研发完成，并于2021-10-27向国家知识产权局提交的专利申请。

本基于后处理方式的蛋白质与ATP绑定残基预测方法在说明书摘要公布了：一种基于后处理方式的蛋白质与ATP绑定残基预测方法，对蛋白质的序列信息和三维结构信息，各生成一个大小为L×1的蛋白质配体绑定残基的概率矩阵；将两个概率矩阵合并为一个大小为L×2的矩阵，并在其上使用滑动窗口，对蛋白质中的每个残基获取一个大小为17×2的特征矩阵M；其次，从蛋白质结构数据库PDB中收集已有ATP绑定残基标签的蛋白质信息，处理后构建训练样本集合，并利用支持向量机算法训练预测模型；再次，将待测蛋白质残基的特征矩阵M输入到训练好的模型中，输出预测结果；当预测的ATP绑定残基中有四个残基的Cα原子不在同一平面时，对预测为非ATP绑定的残基进行后处理。本发明计算代价低、预测精确性高。

本发明授权基于后处理方式的蛋白质与ATP绑定残基预测方法在权利要求书中公布了：1.一种基于后处理方式的蛋白质与ATP绑定残基预测方法，其特征在于，所述预测方法包括以下步骤：1输入一个氨基酸残基数目为L的待进行ATP绑定残基预测的蛋白质的序列信息和三维结构信息，分别记作P和S；2对蛋白质的序列信息P，使用I-LBR程序生成一个大小为L×1的蛋白质配体绑定残基的概率矩阵，记作F1；3对蛋白质的三维结构信息S，使用COACH程序同样生成一个大小为L×1蛋白质配体绑定残基的概率矩阵，记作F2；4将F1与F2合并为一个大小为L×2的矩阵，记作F3，并在其首行前和尾行后分别拼接一个大小为8×2的零矩阵，拼接后的矩阵记作Mfea；5使用一个大小为17×2的窗口，以1为步长在矩阵Mfea上向下滑动，每一次滑动，将窗口内第8行所对应的残基作为预测目标，提取一个大小为17×2的特征矩阵，记作M；6从蛋白质结构数据库PDB中收集已有ATP绑定残基标签的蛋白质信息；对每条蛋白质中的每个残基，通过步骤1至5生成其特征矩阵M，再与表示其是否绑定ATP的标签信息相结合，形成对应的样本数据；使用所有蛋白质的所有残基对应的样本数据来构建训练样本集合；7基于步骤6构建的训练样本集合，利用支持向量机算法训练蛋白质与ATP绑定残基的预测模型；8对任一待测的蛋白质，通过步骤1至步骤5，获得每个残基的特征矩阵M，并输入到由步骤7训练得到的预测模型中，输出该残基绑定ATP的概率Q；若Q值大于阈值T，则该残基被预测为ATP绑定残基，否则被预测为非ATP绑定残基；9当步骤8中预测的ATP绑定残基中有四个残基的Cα原子不在同一平面时，对步骤8中所有预测为非ATP绑定的残基进行后处理，过程如下：9.1对于Cα原子不在同一平面的任意四个预测的ATP绑定残基，根据它们的Cα原子坐标，通过如下方程计算它们所在球面对应的球心O及球体半径R： 其中，x,y,z为所在球面的球心O的空间坐标，xi,yi,zi,i＝1,2,3,4,为四个预测的ATP绑定残基中的第i个残基的Cα原子坐标；9.2将通过步骤9.1计算得到的所有球体半径R的最大值记作Rmax，并将其对应球体的球心记作Omax；9.3对步骤8中预测的每一个非ATP绑定残基，计算它的Cα原子与步骤9.2中得到的球心Omax的欧氏距离，记为do；若do小于Rmax时，则将该残基的预测结果更改为ATP绑定残基。

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