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天津师范大学郝彤获国家专利权

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龙图腾网获悉天津师范大学申请的专利构建中华绒螯蟹蛋白互作网络的方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN114822687B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-06-06发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202210045867.3,技术领域涉及:G16B20/30;该发明授权构建中华绒螯蟹蛋白互作网络的方法是由郝彤;孙金生设计研发完成,并于2022-01-17向国家知识产权局提交的专利申请。

构建中华绒螯蟹蛋白互作网络的方法在说明书摘要公布了:一种构建中华绒螯蟹蛋白互作网络的方法:数据的收集:所述的数据有中华绒螯蟹基因序列信息、将PINA数据库中的生物作为参考模式生物,并得到参考模式生物的蛋白序列信息、分别从PINA数据库和STRING数据库获得每个参考模式生物的蛋白互作信息;构建基于参考模式生物的中华绒螯蟹蛋白互作子网络;对多个基于参考模式生物的中华绒螯蟹蛋白互作子网络进行融合;对中华绒螯蟹融合网络进行扩充,得到中华绒螯蟹蛋白互作网络。利用本发明的方法构建的中华绒螯蟹蛋白互作网络是目前规模最大、包含蛋白和蛋白互作关系数量最多的中华绒螯蟹蛋白互作网络,因此,为使用该网络进行的生物学分析提供了更丰富的信息。

本发明授权构建中华绒螯蟹蛋白互作网络的方法在权利要求书中公布了:1.一种构建中华绒螯蟹蛋白互作网络的方法,其特征在于,包括如下步骤:1)数据的收集:包括(1.1)通过中华绒螯蟹基因组或转录组获得中华绒螯蟹基因序列信息;(1.2)将PINA数据库中的生物作为参考模式生物,从Uniprot数据库获得每个所述参考模式生物的蛋白序列信息;(1.3)从PINA数据库获得每个参考模式生物的蛋白互作信息;(1.4)从STRING数据库获得每个参考模式生物的蛋白互作信息;2)构建基于参考模式生物的中华绒螯蟹蛋白互作子网络;3)对多个基于参考模式生物的中华绒螯蟹蛋白互作子网络进行融合;包括:(3.1)确定基于参考模式生物的中华绒螯蟹蛋白互作子网络的融合顺序;(3.2)所述融合顺序由参考模式生物与中华绒螯蟹亲缘关系的远近决定,将亲缘关系由近到远进行排序,亲缘关系近的先融合;(3.3)确定融合顺序后,进行基于参考模式生物的中华绒螯蟹蛋白互作子网络的两两融合,得到中华绒螯蟹融合网络;每一次的融合都要先确定两个相融合的基于参考模式生物的中华绒螯蟹蛋白互作子网络间节点的关系,即相互融合的两个基于参考模式生物的中华绒螯蟹蛋白互作子网络所对应的参考模式生物蛋白间的同源关系;所述的进行基于参考模式生物的中华绒螯蟹蛋白互作子网络的两两融合,具体包括:(3.3.1)将首次融合的两个基于参考模式生物的中华绒螯蟹蛋白互作子网络中的相对近亲缘关系的设定为目标网络,相对远亲缘关系的设定为质询网络,通过蛋白序列比对判断目标网络与质询网络中是否具有相同的蛋白互作关系,具体是通过蛋白序列比对,确定该目标网络中的两个互作蛋白与质询网络中的两个互作蛋白是同源蛋白,则该目标网络与质询网络中具有相同的蛋白互作关系,则提取出该目标网络中相同的蛋白互作关系作为融合网络的一部分;将目标网络与质询网络中不相同的蛋白互作关系添加进融合网络,最终形成融合网络;(3.3.2)将形成的融合网络作为新的目标网络,将下一个待融合的基于参考模式生物的中华绒螯蟹蛋白互作子网络作为新的质询网络,进行第二次融合,如果一共有N个基于参考模式生物的中华绒螯蟹蛋白互作子网络,则需要融合N-1次,最终得到中华绒螯蟹融合网络;4)对中华绒螯蟹融合网络进行扩充,得到中华绒螯蟹蛋白互作网络。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人天津师范大学,其通讯地址为:300387 天津市西青区宾水西道393号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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