申请/专利权人：中国林业科学研究院亚热带林业研究所

申请日：2020-05-29

公开（公告）日：2020-08-14

公开（公告）号：CN111534630A

主分类号：C12Q1/6895(20180101)

分类号：C12Q1/6895(20180101);C12N15/11(20060101)

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2023.07.14#授权;2020.09.08#实质审查的生效;2020.08.14#公开

摘要：本发明涉及分子标记技术领域，具体涉及与油茶种仁含油率相关的SNP分子标记及其应用。本发明提供了48个与油茶种仁含油率高度关联的SNP分子标记，可以解释10.23％～32.66％的含油率表型方差。通过检测该批SNP分子标记，可在苗期进行鉴定和辅助筛选，能够大大节约生产成本，提高选择效率。在油茶育种中，选择本发明的分子标记及其检测方法鉴定出高含油率油茶进行育种，可提高油茶育种的选择效率，加快育种进程。

主权项：1.与油茶种仁含油率相关的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记选自PB.57703.1-685、PB.93518.1-182、PB.93518.1-191、PB.93518.1-224、PB.93518.1-270、PB.93518.1-284、PB.93518.1-288、PB.103793.1-1118、PB.103793.1-1172、PB.103793.1-1175、PB.47687.1-148、PB.47687.1-215、PB.47687.1-258、PB.47687.1-264、PB.47687.1-282、PB.47687.1-297、PB.47687.1-360、PB.47687.1-366、PB.47687.1-367、PB.85097.1-125、PB.85097.1-197、PB.85097.1-293、PB.85097.1-356、PB.85097.1-532、PB.35678.1-1129、PB.70158.1-51、PB.70158.1-187、PB.70158.1-306、PB.70158.1-314、PB.70158.1-408、PB.70158.1-413、PB.70158.1-419、PB.70158.1-473、PB.70158.1-649、PB.70158.1-704、PB.70158.1-707、PB.70158.1-778、PB.70158.1-854、PB.70158.1-930、PB.70158.1-935、PB.70158.1-944、PB.70158.1-1025、PB.76391.3-1354、PB.76391.3-1385、PB.76391.3-1417、PB.63477.1-1109、PB.63477.1-1163和PB.63477.1-1166中的任一个；其中，SNP分子标记PB.57703.1-685含有如SEQIDNO.19所示序列第685位的多态性为CT的核苷酸序列；SNP分子标记PB.93518.1-182含有如SEQIDNO.20所示序列第182位的多态性为TC的核苷酸序列，SNP分子标记PB.93518.1-191含有如SEQIDNO.20所示序列第191位的多态性为TC的核苷酸序列，SNP分子标记PB.93518.1-224含有如SEQIDNO.20所示序列第224位的多态性为GA的核苷酸序列，SNP分子标记PB.93518.1-270含有如SEQIDNO.20所示序列第270位的多态性为GA的核苷酸序列，SNP分子标记PB.93518.1-284含有如SEQIDNO.20所示序列第284位的多态性为GA的核苷酸序列，SNP分子标记PB.93518.1-288含有如SEQIDNO.20所示序列第288位的多态性为CT的核苷酸序列；SNP分子标记PB.103793.1-1118含有如SEQIDNO.21所示序列第1118位的多态性为AG的核苷酸序列，SNP分子标记PB.103793.1-1172含有如SEQIDNO.21所示序列第1172位的多态性为GA的核苷酸序列，SNP分子标记PB.103793.1-1175含有如SEQIDNO.21所示序列第1175位的多态性为AC的核苷酸序列；SNP分子标记PB.47687.1-148含有如SEQIDNO.22所示序列第148位的多态性为AG的核苷酸序列，SNP分子标记PB.47687.1-215含有如SEQIDNO.22所示序列第215位的多态性为GT的核苷酸序列，SNP分子标记PB.47687.1-258含有如SEQIDNO.22所示序列第258位的多态性为CT的核苷酸序列，SNP分子标记PB.47687.1-264含有如SEQIDNO.22所示序列第264位的多态性为CT的核苷酸序列，SNP分子标记PB.47687.1-282含有如SEQIDNO.22所示序列第282位的多态性为TC的核苷酸序列，SNP分子标记PB.47687.1-297含有如SEQIDNO.22所示序列第297位的多态性为CT的核苷酸序列，SNP分子标记PB.47687.1-360含有如SEQIDNO.22所示序列第360位的多态性为AG的核苷酸序列，SNP分子标记PB.47687.1-366含有如SEQIDNO.22所示序列第366位的多态性为TC的核苷酸序列，PB.47687.1-367含有如SEQIDNO.22所示序列第367位的多态性为GC的核苷酸序列；SNP分子标记PB.85097.1-125含有如SEQIDNO.23所示序列第125位的多态性为CG的核苷酸序列，SNP分子标记PB.85097.1-197含有如SEQIDNO.23所示序列第197位的多态性为GC的核苷酸序列，SNP分子标记PB.85097.1-293含有如SEQIDNO.23所示序列第293位的多态性为AG的核苷酸序列，SNP分子标记PB.85097.1-356含有如SEQIDNO.23所示序列第356位的多态性为TG的核苷酸序列，SNP分子标记PB.85097.1-532含有如SEQIDNO.23所示序列第532位的多态性为AT的核苷酸序列；SNP分子标记PB.35678.1-1129含有如SEQIDNO.24所示序列第1129位的多态性为GC的核苷酸序列；SNP分子标记PB.70158.1-51含有如SEQIDNO.25所示序列第51位的多态性为GA的核苷酸序列，SNP分子标记PB.70158.1-187含有如SEQIDNO.25所示序列第187位的多态性为AG的核苷酸序列，SNP分子标记PB.70158.1-306含有如SEQIDNO.25所示序列第306位的多态性为CT的核苷酸序列，SNP分子标记PB.70158.1-314含有如SEQIDNO.25所示序列第314位的多态性为AG的核苷酸序列，SNP分子标记PB.70158.1-408含有如SEQIDNO.25所示序列第408位的多态性为TG的核苷酸序列，SNP分子标记PB.70158.1-413含有如SEQIDNO.25所示序列第413位的多态性为TA的核苷酸序列，SNP分子标记PB.70158.1-419含有如SEQIDNO.25所示序列第419位的多态性为AT的核苷酸序列，SNP分子标记PB.70158.1-473含有如SEQIDNO.25所示序列第473位的多态性为CG的核苷酸序列，SNP分子标记PB.70158.1-649含有如SEQIDNO.25所示序列第649位的多态性为AG的核苷酸序列，SNP分子标记PB.70158.1-704含有如SEQIDNO.25所示序列第704位的多态性为GA的核苷酸序列，SNP分子标记PB.70158.1-707含有如SEQIDNO.25所示序列第707位的多态性为AC的核苷酸序列，SNP分子标记PB.70158.1-778含有如SEQIDNO.25所示序列第778位的多态性为CT的核苷酸序列，SNP分子标记PB.70158.1-854含有如SEQIDNO.25所示序列第854位的多态性为AC的核苷酸序列，SNP分子标记PB.70158.1-930含有如SEQIDNO.25所示序列第930位的多态性为CG的核苷酸序列，SNP分子标记PB.70158.1-935含有如SEQIDNO.25所示序列第935位的多态性为TG的核苷酸序列，SNP分子标记PB.70158.1-944含有如SEQIDNO.25所示序列第944位的多态性为AT的核苷酸序列，SNP分子标记PB.70158.1-1025含有如SEQIDNO.25所示序列第1025位的多态性为CT的核苷酸序列；SNP分子标记PB.76391.3-1354含有如SEQIDNO.26所示序列第1354位的多态性为AC的核苷酸序列，SNP分子标记PB.76391.3-1385含有如SEQIDNO.26所示序列第1385位的多态性为GA的核苷酸序列，SNP分子标记PB.76391.3-1417含有如SEQIDNO.26所示序列第1417位的多态性为TC的核苷酸序列；SNP分子标记PB.63477.1-1109含有如SEQIDNO.27所示序列第1109位的多态性为AG的核苷酸序列，SNP分子标记PB.63477.1-1163含有如SEQIDNO.27所示序列第1163位的多态性为GA的核苷酸序列，SNP分子标记PB.63477.1-1166含有如SEQIDNO.27所示序列第1166位的多态性为AC的核苷酸序列。

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百度查询： 中国林业科学研究院亚热带林业研究所 与油茶种仁含油率相关的SNP分子标记及其应用

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