申请/专利权人:安徽农业大学
申请日:2019-07-24
公开(公告)日:2020-09-15
公开(公告)号:CN111663005A
主分类号:C12Q1/70(20060101)
分类号:C12Q1/70(20060101);C12Q1/6851(20180101)
优先权:
专利状态码:失效-发明专利申请公布后的驳回
法律状态:2023.04.21#发明专利申请公布后的驳回;2020.10.13#实质审查的生效;2020.09.15#公开
摘要:本发明公开了一种用于检测猪细小病毒6型的荧光定量PCR方法,包括如下步骤:S1、制备特异性引物;根据GenBankPPV6的Cap基因序列,登录号:KU563733.1,应用PrimerPremier5.0软件设计一对特异性引物如下:F:5’‑GAAAAAGAACAGGCGCAGAC‑3’,R:5’‑GGGATTATGAAGCCAGACG‑3’;S2、重组质粒标准品制备并提取DNA;取适量采集的淋巴结、脾、肺等组织加入含青霉素和链霉素各1000IUml的PBS匀浆用研钵充分碾磨;反复冻融3次,6000rmin离心10min,取上清液,置于‑80℃冰箱待用;将制备好的样品按照DNARNA提取试剂盒使用说明书提取DNA;本发明提供一种能够快速、简便、灵敏地检测猪细小病毒6型的方法;本发明根据Cap基因设计特异性引物,建立了一种基于SYBRGreenI的real‑time荧光定量PCR检测方法。
主权项:1.一种用于检测猪细小病毒6型的荧光定量PCR方法,其特征在于:包括如下步骤:S1、制备特异性引物;根据GenBankPPV6的Cap基因序列,登录号:KU563733.1,应用PrimerPremier5.0软件设计一对特异性引物如下:F:5’-GAAAAAGAACAGGCGCAGAC-3’,R:5’-GGGATTATGAAGCCAGACG-3’;S2、重组质粒标准品制备并提取DNA;取适量采集的淋巴结、脾、肺等组织加入含青霉素和链霉素各1000IUml的PBS匀浆用研钵充分碾磨;反复冻融3次,6000rmin离心10min,取上清液,置于-80℃冰箱待用;将制备好的样品按照DNARNA提取试剂盒使用说明书提取DNA;S3、PCR扩增;利用特异性引物用对提取的DNA模板进行PCR扩增,扩增条件95℃5min;95℃30s,56℃30s,72℃20s,30个循环;72℃10min;S4、扩增检测处理;对PCR产物进行处理,并对鉴定为阳性的重组质粒进行测序;S5、荧光定量PCR方法的建立;将提取的质粒模板进行10倍梯度稀释作为标准品模板,制作标准曲线;S6、灵敏度检测;以10倍梯度稀释的8个梯度4.78×101copiesμL~4.78×108copiesμL的标准质粒为模板进行qPCR扩增,同时进行普通PCR;观察qPCR最低检出模板拷贝浓度,并于普通PCR比较分析;S7、特异性检测;采用猪细小病毒7型PPV7、猪圆环病毒2型PCV2、猪圆环病毒3型PCV3、猪流行性腹泻病毒PEDV、猪蓝耳病毒PRRSV和猪伪狂犬病毒PRV中任一或多种组合的猪DNA或RNA病毒进行qPCR检测特异性对其进行了评价,并以ddH2O作为阴性对照。
全文数据:
权利要求:
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