申请/专利权人：中国农业科学院北京畜牧兽医研究所

申请日：2020-03-18

公开（公告）日：2020-10-16

公开（公告）号：CN111243667B

主分类号：G16B20/30(20190101)

分类号：G16B20/30(20190101);G16B20/20(20190101);G16B35/20(20190101)

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2020.10.16#授权;2020.06.30#实质审查的生效;2020.06.05#公开

摘要：本发明公开了华西牛基因组选择方法，要解决的是现有肉牛育种群制种供种能力不足的问题。本发明的具体步骤如下：步骤一，构建参考群体并且测定经济性状；步骤二，对参考群体进行基因分型并且对数据进行处理和质量控制；步骤三，进行基因型数据填充，得到测序数据，然后进行QTL位点的筛选；步骤四，计算参考群体中各个性状的全部SNP标记的效应值；步骤五，得到候选群体基因组育种值，依据每个性状的基因组估计育种值计算个体的综合选择指数。本发明的目的是建立基于基因组选择技术的高效优质华西牛选育方法，全面提高我国肉牛种群选择效率，大幅节约育种成本，为优质华西牛的培育提供分子育种方法，推动肉牛种业的快速发展。

主权项：1.华西牛基因组选择方法，其特征在于，具体步骤如下：步骤一，构建参考群体并且测定经济性状；步骤二，对参考群体的每头牛采血保存，提取DNA并且进行基因分型，对基因分型后的数据进行处理和质量控制；步骤三，对处理后的基因分型数据进行基因型数据填充，得到测序数据，然后进行QTL位点的筛选，所述QTL位点包括与断奶重、育肥期日增重、胴体重、屠宰率和产犊难易度相关的显著SNPs；步骤四，将筛选出的QTL位点与测序数据整合，得到标准数据，计算各个性状的全部SNP标记的效应值；步骤五，对候选群体进行采血和提取DNA，进行基因分型，质量控制后填充至标准数据，利用参考群体估计的全部SNP标记的效应值和QTL位点效应值，将候选群体的基因型向量与位点效应值向量相乘，即可得到候选群体的基因组估计育种值，依据每个性状的基因组估计育种值计算个体的综合选择指数，所述个体的综合选择指数GCBI公式如下： 其中GebvCE为产犊难易度基因组估计育种值，GebvWWT为断奶重基因组估计育种值，GebvDG_F为育肥期日增重基因组估计育种值，GebvCW为胴体重基因组估计育种值，GebvDP为屠宰率基因组估计育种值。

全文数据：

权利要求：

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