申请/专利权人：南京理工大学

申请日：2021-03-30

公开（公告）日：2021-07-16

公开（公告）号：CN113129997A

主分类号：G16B15/00(20190101)

分类号：G16B15/00(20190101);G06K9/62(20060101)

优先权：

专利状态码：失效-未缴年费专利权终止

法律状态：2024.04.05#未缴年费专利权终止;2022.09.13#授权;2021.08.03#实质审查的生效;2021.07.16#公开

摘要：本发明公开了一种提取β‑CD主客体体系代表性构象的MDQMCSM方法。所述方法包括：1计算主体分子的拓扑结构和RESP电荷；2计算客体分子的拓扑结构和RESP电荷；3构建主客体复合物的初始构象；4筛选主客体复合物、主体分子和客体分子的优势构象；5对主客体复合物优势构象进行ECD计算，与ICD实验相对照，确定筛选结构的准确性；6将主客体复合物、主体分子和客体分子的优势构象共采用QMCSM方法计算包合自由能，计算值与实验值进行线性相关性分析。本发明能准确的提取主客体复合体系的代表性构象，为包合自由能计算提供了准确的结构模型，同时计算了真空中的包合自由能和溶剂效应，使主客体体系包合自由能的计算更为完善，为实验提供指导。

主权项：1.提取β-CD主客体体系代表性构象的MDQMCSM方法，其特征在于，包括以下步骤：1将主体分子β-CD采用q4md-CD力场，得到β-CD的拓扑结构和在HF6-31G*水平上计算得到RESP电荷；2将N-甲基氨基甲酸酯类客体分子采用GAFF力场，得到客体分子的拓扑结构和在HF6-31G*水平计算得到RESP电荷；3调节步骤1中经过电荷和拓扑计算后的主体分子，与步骤2中经过电荷和拓扑计算后的客体分子的取向，构建主客体复合物的初始构象；4将主客体复合物的初始构象进行MD模拟，得到复合构象，调节阈值，进行聚类分析和结构优化，筛选出复合物优势构象；同时，分别对步骤1中的主体分子和步骤2中的客体分子进行MD模拟，调节阈值，进行聚类分析和结构优化，分别筛选出主体分子和客体分子优势构象；5对步骤4得到复合物优势构象进行ECD计算，与ICD实验相对照，确定所筛选结构的准确性，如果一致则进行步骤6，如果不一致则返回进行步骤3；6将步骤5中经过ECD计算检验后的复合物优势构象与步骤4中筛选出主体分子和客体分子优势构象共同采用QMCSM方法计算包合自由能，计算的包合自由能与实验值进行线性相关性分析；如果计算值与实验值有良好的线性相关性，则表示筛选的优势构象为主客体复合物准确的代表性构象，如果计算值与实验值没有良好的线性相关性，则返回进行步骤3。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 南京理工大学 提取β-CD主客体体系代表性构象的MD/QM/CSM方法

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