申请/专利权人：上海顿慧医疗科技发展有限公司

申请日：2020-09-02

公开（公告）日：2022-10-14

公开（公告）号：CN112011616B

主分类号：C12Q1/6886

分类号：C12Q1/6886;G16B40/00;G16H50/20

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2022.10.14#授权;2020.12.18#实质审查的生效;2020.12.01#公开

摘要：本发明涉及一种预测肝细胞癌肿瘤免疫浸润和术后生存时间的免疫基因预后模型，属于生物医药技术领域。模型通过检测肝细胞癌患者特定的22个免疫相关基因的表达水平，在临床实践中可用于评估肿瘤内免疫细胞浸润程度，提高对肝癌免疫治疗反应的预测能力；可用于判断患者术后总体生存风险，指导术后治疗策略的制定，相应的微阵列芯片试剂盒可实现检测的标准化和便捷化。同时，本发明提供的免疫基因预后模型可增加肝细胞癌TNM分期系统对术后3年和5年总体生存时间的预测准确性以及临床净收益。本发明作为客观、准确评估肝细胞癌肿瘤免疫状态和预后不良风险的分子标志物，可实现肝细胞癌免疫治疗精准实施和预后准确预测。

主权项：1.构建一种预测肝细胞癌肿瘤免疫浸润和术后生存时间的免疫基因预后模型的方法，其特征在于，所述一种预测肝细胞癌肿瘤免疫浸润和术后生存时间的免疫基因预后模型的风险评分由22种免疫相关基因表达水平经相应系数权重后的总和计算获得，可预测肿瘤免疫细胞浸润程度及患者预后不良风险；所述22种免疫相关基因为VIPR1、IL20RA、RETN、STC2、PLAUR、NR0B1、PSMD14、GMFB、CAMP、GLP1R、ULBP2、GAL、HDGF、TNF、CCR7、CXCL5、CCR8、BMP6、C5、EPO、GHR和BRD8；构建方法包括以下步骤：步骤1：收取一定数量的肝细胞癌肿瘤样本，提取肿瘤RNA进行纯化和测序；将患者资料随机分入训练集和验证集；步骤2：通过单因素COX回归分析，在训练集中鉴定与预后显著相关的免疫相关基因，再通过LASSO回归分析，确定最终纳入预后模型的基因及风险评分计算公式，从而构建免疫基因预后模型；步骤3：根据模型的计算公式计算训练集中每个样本的风险评分，基于样本风险评分的中位数将患者分为高风险组和低风险组，分析两组患者肿瘤免疫浸润状态和术后总体生存差异；在训练集中通过多因素COX比例风险回归分析和ROC曲线评估模型的预测性能；所述每个样本的风险评分设为模型中免疫相关基因的mRNA表达水平经相应系数加权后的总和；肿瘤免疫浸润状态的评估是通过单样本基因集富集分析对训练集肝细胞癌患者肿瘤转录组数据进行分析获得的；步骤4：将上述基于免疫相关基因的预后模型在验证集中验证其预后价值；计算验证集中每个样本的风险评分，并根据训练集中的中位数分为高风险组和低风险组，比较两组患者术后总体生存时间有无显著差异。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 上海顿慧医疗科技发展有限公司 预测肝细胞癌肿瘤免疫浸润和术后生存时间的免疫基因预后模型

免责声明
1、本报告根据公开、合法渠道获得相关数据和信息，力求客观、公正，但并不保证数据的最终完整性和准确性。
2、报告中的分析和结论仅反映本公司于发布本报告当日的职业理解，仅供参考使用，不能作为本公司承担任何法律责任的依据或者凭证。

阅读全文 双屏查看 官方信息 专利公告 收藏专利 下载PDF 下载WORD