申请/专利权人:中国计量科学研究院
申请日:2021-04-08
公开(公告)日:2023-01-06
公开(公告)号:CN113151425B
主分类号:C12Q1/6869
分类号:C12Q1/6869
优先权:
专利状态码:有效-授权
法律状态:2023.01.06#授权;2021.08.10#实质审查的生效;2021.07.23#公开
摘要:本发明公开一种基于关键指标提高准确性的单细胞测序方法。建立了10XGenomics和BDRhapsody平台样本制备方法并加以优化确定了关键参数,确定单细胞转录组测序技术样本的评价标准;通过建立细胞系对不同单细胞转录组测序平台的结果分析,进而解决单细胞转录组测序技术存在可比性和重复性差、缺乏质量控制标准的问题。
主权项:1.一种基于关键指标提高准确性的单细胞测序方法,其中测序平台是10XGenomics,或BDRhapsody平台,其特征在于,单细胞测序的样本满足下述标准:细胞活性80%,细胞浓度700-1200cellsuL,细胞直径5-40um;单细胞测序上机样本满足下述要求:cDNA产量大于150ng;片段长度范围200bp~9000bp;主峰值在1000-2000之间;cDNA浓度1~60ngul;测序文库达到下述要求:片段大小位于400-500bp;文库峰位于250bp-1500bp之间;Qubit浓度=4ngul;所述单细胞测序是指采用IlluminaHiseqPE150或NovaSeqPE150测序策略,每个细胞测50,000-100,000条reads,或每个细胞测15-30M数据量;所述单细胞是细胞系A549或NIH3T3。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 中国计量科学研究院 基于关键指标提高准确性的单细胞测序方法
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