申请/专利权人:中国科学技术大学
申请日:2021-07-08
公开(公告)日:2023-03-14
公开(公告)号:CN113528612B
主分类号:C12Q1/6806
分类号:C12Q1/6806
优先权:
专利状态码:有效-授权
法律状态:2023.03.14#授权;2021.11.09#实质审查的生效;2021.10.22#公开
摘要:本发明提供了检测染色质开放位点间染色质相互作用的NicE‑C方法,其参考了NicE‑seq与Hi‑C技术,在前期用NicE‑seq技术中使用的Nt.CivPII和DNA聚合酶I这两个酶替代Hi‑C技术中使用的限制性内切酶进行染色质切割,从而实现对染色质开放位点的切割。后续参考Hi‑C技术等在末端补平不需在此处加入生物素标记,加dA尾后通过生物素标记的桥接头连接来实现对染色质相互作用的捕获。本发明具有样品起始细胞量少,操作简便,信号富集效果好,分辨率高等特点。
主权项:1.检测待测样品中染色质开放位点间染色质相互作用的NicE-C方法,其特征在于,包括:a.对样品中的染色质包括DNA、蛋白以及RNA进行交联;b.通过Nt.CivPII和E.coliDNA聚合酶I在染色质开放区域进行切口反应切割基因组DNA;c.进行末端修复,在修复的末端上加尾,所述加尾选自dA,dT,dG,dC中的任何一种;d.引入带标记的桥接头,所述标记选自生物素标记或地高辛标记;e.解交联,破碎DNA,富集带标记的DNA片段。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 中国科学技术大学 用于检测染色质开放位点间染色质相互作用的NicE-C技术
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