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【发明授权】一种山羊CMTM2基因CNV标记的检测方法与应用_西北农林科技大学_202110374309.7 

申请/专利权人:西北农林科技大学

申请日:2021-04-07

公开(公告)日:2023-05-16

公开(公告)号:CN112980969B

主分类号:C12Q1/6888

分类号:C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11

优先权:

专利状态码:有效-授权

法律状态:2023.05.16#授权;2021.07.06#实质审查的生效;2021.06.18#公开

摘要:本发明公开了一种山羊CMTM2基因CNV标记的检测方法与应用:以山羊基因组DNA为模板,以引物对P1和P2为引物,通过实时荧光定量PCR分别扩增山羊CMTM2基因CNV区域和内参基因MC1R的部分片段,根据2×2‑ΔΔCt将定量结果分为插入型、缺失型和正常型,从而鉴定山羊CMTM2基因候选区域Chr18:35601201bp‑35603200bp的CNV类型。根据CMTM2基因的CNV类型与山羊生长性状的关联分析结果,本发明可在DNA水平上检测与山羊生长性状密切相关的CNV标记,从而通过山羊生长性状的标记辅助选择,快速建立遗传资源优良的山羊种群。

主权项:1.一种检测山羊CMTM2基因拷贝数变异的方法,其特征在于:包括以下步骤:以山羊基因组DNA为模板,以引物对P1和引物对P2为引物,通过实时荧光定量PCR分别扩增CMTM2基因的拷贝数变异区域和作为内参的MC1R基因的部分片段,然后根据定量结果鉴定山羊CMTM2基因的拷贝数变异类型;所述引物对P1为:上游引物F1:5′-TCTGAAAGAGTTGGGAATACAAGA-3′下游引物R1:5′-CATAGAAGTTAAATAAGCAGGGTGA-3′;所述引物对P2为:上游引物F2:5′-GGCCTGAGAGGGGAATCACA-3′下游引物R2:5′-AGTGGGTCTCTGGATGGAGG-3′;所述CMTM2基因的拷贝数变异区域位于山羊CMTM2基因候选区域Chr18:35601201bp-35603200bp,参考序列为GenBankOar_v4.0;所述拷贝数变异类型是根据2×2-ΔΔCt将定量结果分为的三类:插入型,2×2-ΔΔCt≥3;缺失型,2×2-ΔΔCt2;正常型,2×2-ΔΔCt=2;所述山羊为陕北白绒山羊。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 西北农林科技大学 一种山羊CMTM2基因CNV标记的检测方法与应用

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