申请/专利权人：珠海圣美生物诊断技术有限公司

申请日：2023-04-18

公开（公告）日：2023-05-23

公开（公告）号：CN116153417A

主分类号：G16B40/00

分类号：G16B40/00;G16B30/10

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2023.06.30#授权;2023.06.09#实质审查的生效;2023.05.23#公开

摘要：本发明提供一种甲基化特征筛选方法及装置，属于生物数据处理技术领域，所述方法包括：通过移窗法对各目标甲基化差异区域的核酸序列数据进行目标长度的窗口分割，进而根据特征分数差值以及基因片段断点位置筛选得到用于下游检测场景的第二目标窗口。本发明的甲基化特征筛选方法，通过对各目标甲基化差异区域的核酸序列数据进行目标长度的窗口分割，可以确定出适合下游检测场景的甲基化差异区域，再按照不同类型样本的特征分数差值对各目标甲基化差异区域在各个窗口内的基因数据进一步筛选，滤除低连续甲基化位点检出概率的窗口后进而得到长度适宜且准确的窗口来进行下游检测。

主权项：1.一种甲基化特征筛选方法，其特征在于，包括：通过移窗法对各目标甲基化差异区域的核酸序列数据进行目标长度的窗口分割，并确定分割后各个窗口的起始位点和终止位点坐标数据；所述目标甲基化差异区域的核酸序列数据为基于不同类型样本的核酸序列数据并按照目标条件筛选得到的；所述目标条件用于筛选不同类型样本的核酸序列数据中差异绝对值大于目标阈值的甲基化差异区域；所述目标长度是基于下游检测场景所需的长度确定的；基于各个窗口的起始位点和终止位点的坐标数据，确定各目标甲基化差异区域在各个窗口内的特征分数差值，并根据特征分数差值筛选得到第一目标窗口的核酸序列数据；从所述第一目标窗口的核酸序列数据中过滤存在核酸序列片段断点的窗口或窗口内的断点区域，得到第二目标窗口的坐标数据，所述第二目标窗口的坐标数据用于进行下游检测。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 珠海圣美生物诊断技术有限公司 甲基化特征筛选方法及装置

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