申请/专利权人:上海源兹生物科技有限公司
申请日:2019-08-27
公开(公告)日:2022-02-11
公开(公告)号:CN110544506B
主分类号:G16B15/30(20190101)
分类号:G16B15/30(20190101);G16B20/30(20190101);G16B25/10(20190101)
优先权:
专利状态码:有效-授权
法律状态:2022.02.11#授权;2019.12.31#实质审查的生效;2019.12.06#公开
摘要:本发明提供一种基于蛋白互作网络的靶点PPIs可药性预测方法,至少包括以下步骤:S1:检测PPI网络中互作蛋白结构域的互作关系;S2:探测PPI网络中互作蛋白表面的药物小分子结合口袋;S3:获得PPI网络中互作蛋白的GO功能相似性分值;S4:筛选出同时满足以下条件的PPIs作为药物治疗靶点:蛋白互作关系对存在结构域互作;蛋白互作关系对中,至少有一个蛋白表面存在小分子药物结合口袋;蛋白互作关系对的互作蛋白的GO功能类别中,至少两类具有显著相似性,所述GO功能类别包括GOBP、GOMF和GOCC。本发明同时采用严格的三个相互独立标准全面探索和发现目标PPI,系统排除了假阳性相互作用,选择更可靠的PPIs作为药物靶点,计算结果更符合客观现实。
主权项:1.一种基于蛋白互作网络的靶点PPIs可药性预测方法,所述方法至少包括以下步骤:S1:检测PPI网络中互作蛋白结构域的互作关系;S2:探测PPI网络中互作蛋白表面的药物小分子结合口袋;S3:获得PPI网络中互作蛋白的GO功能相似性分值;S4:筛选出同时满足以下条件的PPIs作为药物治疗靶点:i蛋白互作关系对存在结构域互作;ii蛋白互作关系对中,至少有一个蛋白表面存在小分子药物结合口袋;iii蛋白互作关系对的互作蛋白的GO功能类别中,至少两类具有显著相似性,所述GO功能类别包括GOBP、GOMF和GOCC。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 上海源兹生物科技有限公司 基于蛋白互作网络的靶点PPIs可药性预测方法及装置
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