申请/专利权人：阿尔塞迪亚格公司

申请日：2020-11-09

公开（公告）日：2022-08-19

公开（公告）号：CN114929898A

主分类号：C12Q1/6883

分类号：C12Q1/6883;G16B30/00

优先权：["20191108 EP 19208124.8"]

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2022.09.06#实质审查的生效;2022.08.19#公开

摘要：本发明涉及一种用于使用与特定抑郁评分和算法相关联的特定A至I编辑RNA生物标志物中的至少一个或组合来从人类患者的生物样本中体外诊断所述患者的心境障碍，特别是抑郁障碍，更优选地是重度抑郁发作DEP的方法。本发明还涉及一种用于监测人类受试者的心境障碍的治疗，优选地用于监测抑郁的方法，所述方法实施本发明的用于诊断心境障碍的所述方法。用于确定患者是否表现出心境障碍，优选地是抑郁障碍，更优选地是DEP的试剂盒也包含在本发明中。

主权项：1.一种用于选择至少两个生物标志物的组合的方法，所述方法能够用于从人类患者的血样中诊断所述患者的抑郁障碍，优选地是重度抑郁发作DEP，所述方法包含以下步骤：a使用Editome分析流水线分析RNA-Seq数据集，并以30x的最小覆盖度识别A至I差异经编辑位置，这确保了在特定碱基位置处的高置信度；b执行差异分析以识别在患有抑郁障碍，优选地是DEP的患者与健康对照之间编辑能够特别不同的位点，c应用由以下组成的组的以下预先指定的质量准则：覆盖度30；AUC0.6；0.95变化倍数1.05，p0.05并且排除基因间位点；d任选地，检查在患者与对照之间未观察到全局RNA编辑的差异，优选地通过计算全局Alu编辑指数AEI，AEI是Alu重复序列中RNA编辑的总体速率的量度；e通过对步骤c或d中的生物标志物选择进行GSEA对基因集合的富集分析，优选地通过使用基因本体工具，识别和选择反映包括免疫和CNS中枢神经系统功能的不同生物过程中的变化的生物标志物；以及f应用由以下组成的组的以下指定质量准则：覆盖度30；AUC0.8；0.8变化倍数1.20并且p0.05至在步骤e中选择的表示不同生物机制的若干生物标志物的组合，以及选择在两个单独的组中清楚地区分健康对照与患有抑郁障碍，优选地是重度抑郁发作DEP的患者的那些生物标志物。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 阿尔塞迪亚格公司 使用血液RNA编辑生物标志物诊断心境障碍

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