申请/专利权人：广东省中医院(广州中医药大学第二附属医院、广州中医药大学第二临床医学院、广东省中医药科学院)

申请日：2022-11-07

公开（公告）日：2023-04-25

公开（公告）号：CN116004893A

主分类号：C12Q1/6895

分类号：C12Q1/6895;C12Q1/6869;C12N15/11;C12N15/29

优先权：

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2023.05.12#实质审查的生效;2023.04.25#公开

摘要：本发明公开了一种阳春砂和海南砂种间杂交种及其亲本的鉴定方法，提供了阳春砂和海南砂的单倍型分子标记，所述单倍型分子标记含有4个SNP位点；所述鉴定方法为：提取被鉴定的样本的基因组DNA；对基因组DNA进行高通量测序；以核苷酸序列如SEQIDNO：2所示的序列作为参比序列，检测高通量测序数据的单倍型分子标记类型，判定被鉴定的样本的品种；还根据被鉴定的样本及其相近物种的叶绿体基因组构建系统发生树，判定被鉴定的样本的母本。本发明提供了一种简便、高效的阳春砂和海南砂种间杂交物种分子鉴定的方法，根据ITS2基因的单倍型鉴定植物种间杂交种，同时结合叶绿体基因组分析，有效判定杂交种的亲本来源，解决了种间杂交种不易区分鉴定的技术难题。

主权项：1.一种用于鉴定阳春砂和海南砂种间杂交种的单倍型分子标记，其特征在于，所述单倍型分子标记含有SNP位点1～4；SNP位点1：位于ITS2基因的第134位核苷酸，该位点的核苷酸碱基为C或T；SNP位点2：位于ITS2基因的第164位核苷酸，该位点的核苷酸碱基为C或T；SNP位点3：位于ITS2基因的第172位核苷酸，该位点的核苷酸碱基为G或T；SNP位点4：位于ITS2基因的第199位核苷酸，该位点的核苷酸碱基为G或A；所述ITS2基因的核苷酸序列如SEQIDNO：2所示。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 广东省中医院(广州中医药大学第二附属医院、广州中医药大学第二临床医学院、广东省中医药科学院) 一种阳春砂和海南砂种间杂交种及其亲本的鉴定方法

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