申请/专利权人：中国农业大学

申请日：2023-07-03

公开（公告）日：2023-10-27

公开（公告）号：CN116941569A

主分类号：A01K67/02

分类号：A01K67/02;A01K29/00;G16B20/30;G16B40/00

优先权：

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2023.11.14#实质审查的生效;2023.10.27#公开

摘要：本发明公开了利用精子表观遗传时钟预测公牛年龄的装置、方法及计算机可读存储介质与应用。本发明的方法使用公牛精子甲基化位点的已知甲基化谱数据基于甲基化水平值的变异度进行筛选得到83个筛选甲基化位点，基于弹性网络回归算法使用筛选甲基化位点构建获得表观遗传时钟，使用所述表观遗传时钟可预测获得所述待测公牛的年龄。根据表观遗传时钟可预测公牛的年龄，并根据表观遗传加速度可预测公牛精液的品质，可应用于公牛品种选育和公牛育种。

主权项：1.预测公牛年龄的装置，其特征在于：所述装置包括如下模块：A1甲基化位点筛选模块：用于获得公牛精子甲基化位点的已知甲基化谱数据，依据所述已知甲基化谱数据中甲基化水平值的变异度，对所述已知甲基化谱数据中的所述甲基化位点进行筛选得到筛选甲基化位点；A2表观遗传时钟构建模块：用于使用所述已知甲基化谱数据中所述筛选甲基化位点的甲基化谱数据，基于弹性网络回归算法构建获得表观遗传时钟；所述表观遗传时钟的公式为如下式I：fx＝a1m1+a2m2+a3m3+…+axmx+b式I式I中，fx代表生理年龄或表观遗传年龄；a代表每个CpG位点对应的系数；a1-ax代表第1个CpG位点对应的系数值至第x个CpG位点对应的系数值；x代表CpG位点的个数，m代表每个CpG位点的甲基化水平值；m1-mx代表第1个CpG位点的甲基化水平值至第x个CpG位点的甲基化水平值；b代表截距值；A3数据获得模块：用于获得待测公牛精子的甲基化位点的甲基化谱数据；A4年龄预测模块：用于基于所述待测公牛精子的甲基化位点的甲基化谱数据，使用所述表观遗传时钟预测获得所述待测公牛的年龄。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 中国农业大学 利用精子表观遗传时钟预测公牛年龄的装置、方法及计算机可读存储介质与应用

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