申请/专利权人:深圳市华大海洋研究院
申请日:2022-06-22
公开(公告)日:2023-10-27
公开(公告)号:CN115627295B
主分类号:C12Q1/6888
分类号:C12Q1/6888;C12Q1/6869;C12N15/11;G16B30/10;G16B30/20
优先权:
专利状态码:有效-授权
法律状态:2023.10.27#授权;2023.02.14#实质审查的生效;2023.01.20#公开
摘要:本发明公开一种小布氏鲸物种鉴定方法及试剂盒,其中,小布氏鲸物种鉴定方法包括如下步骤:采用33组引物对所述总环境DNA进行多重PCR扩增;针对上述多重PCR扩增产物进行高通量测序;去掉测序产生的接头序列、无引物非特异性扩增序列;去掉未比对上参考数据库的序列;将剩余序列进行组装,得到相对于单个序列更长的contig序列;将得到的contig序列与小布氏鲸及小布氏鲸的近源物种的DNA序列进行比对。本发明提出了一种环境DNA样品检测技术,该技术采用eDNA、多重PCR和高通量测序等三种技术相结合的模式,综合了现有eDNA技术两种主流策略的优点,规避了两者的缺点,实现特定海域中小布氏鲸的物种鉴定,具有技术成本低、灵敏度高、精确度高的优点。
主权项:1.一种小布氏鲸物种鉴定方法,其特征在于,包括如下步骤:a、提取海水样本中的总环境DNA;b、采用如SEQIDNO.1至SEQIDNO.66所示序列的引物对所述总环境DNA进行多重PCR扩增;c、针对上述多重PCR扩增产物进行高通量测序;d、去掉测序产生的接头序列、无引物非特异性扩增序列;e、去掉未比对上NCBI数据库中须鲸属物种的线粒体全基因组数据库的序列;f、将剩余序列进行组装,得到相对于单个序列更长的contig序列;g、将得到的contig序列与如NCBI:AB201258.1所示小布氏鲸线粒体全基因组序列及小布氏鲸的近源物种的线粒体全基因组序列进行比对。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 深圳市华大海洋研究院 试剂盒及小布氏鲸物种鉴定方法
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