申请/专利权人：复旦大学附属中山医院

申请日：2023-10-20

公开（公告）日：2024-03-08

公开（公告）号：CN117672379A

主分类号：G16B40/20

分类号：G16B40/20;G16B30/10;G16H70/40

优先权：

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2024.03.26#实质审查的生效;2024.03.08#公开

摘要：本发明涉及一种基于补体通路预测肾癌靶免联合治疗效果的方法，属于生物信息技术领域。包括收集样本、提取RNA文库、得到归一化处理后的补体旁路途径评分、定义高补体旁路途径评分组、低补体旁路途径评分组、利用ACPS评分来预测酪氨酸激酶抑制剂联合免疫治疗的治疗耐药性。本技术方案通过转录组测序、ssGSEA计算、ACPS评分预测等步骤，为转移性肾细胞癌患者进行TKI+IO联合治疗提供了可靠的预测指标，有望指导临床决策并改善患者的预后。

主权项：1.一种可以基于补体通路预测肾癌靶免联合治疗效果的方法，其特征在于，包括以下步骤：步骤1：收集酪氨酸激酶抑制剂联合免疫治疗的患者的组织样本，和治疗反应信息，包括治疗应答和治疗耐药状态；并收集患者的随访资料，计算每一例患者的无进展生存时间；步骤2：提取RNA并制备RNA文库、进行纯化；步骤3：将RNA文库进行转录组测序，并进行数据预处理，得到高质量的清洁数据，并计算得到每个基因的表达量；步骤4：采用单样本基因集富集分析方法，根据补体旁路途径基因的表达量，计算每个样本的补体旁路途径评分，并使用z-score方法进行归一化，得到归一化处理后的补体旁路途径评分，即ACPS评分；步骤5：将上述经过z-score归一化处理后的ACPS评分高于0定义为高补体旁路途径评分组，ACPS评分低于0定义为低补体旁路途径评分组；步骤6：利用ACPS评分来预测TKI+IO联合治疗的治疗耐药性，包括以下步骤：1.使用Mann-WhitneyU检验比较酪氨酸激酶抑制剂联合免疫治疗耐药组和治疗应答组之间，ACPS评分的差异；2.对比高ACPS组和低ACPS组患者，酪氨酸激酶抑制剂联合免疫治疗前后的影像学表现变化，明确高ACPS组和低ACPS组治疗效果的差异；3.对每一例患者TKI+IO联合治疗后的治疗效果，根据实体瘤疗效评价标准进行评估，并使用卡方检验比较高ACPS组和低ACPS组患者治疗效果的差异，从而判断ACPS评分是否是一种可靠的预测指标，可以用来识别可能对TKI+IO联合治疗产生耐药性的患者；步骤7：使用ACPS评分来预测酪氨酸激酶抑制剂联合免疫治疗的预后获益，即通过生存分析，比较上述高ACPS评分组和低ACPS评分组患者的无进展生存时间差异，通过Kaplan-Meier统计学方法，计算两组之间的差异是否具有统计学显著差异，从而确定ACPS评分与TKI+IO联合治疗的预后获益之间的关系。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 复旦大学附属中山医院 一种基于补体通路预测肾癌靶免联合治疗效果的方法

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