申请/专利权人：艾德范思(北京)医学检验实验室有限公司

申请日：2021-09-17

公开（公告）日：2024-03-08

公开（公告）号：CN113793640B

主分类号：G16B30/00

分类号：G16B30/00;G16B40/00

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.03.08#授权;2021.12.31#实质审查的生效;2021.12.14#公开

摘要：本发明公开了基于二代测序的微生物16S扩增子数据分析的装置及方法。本发明所保护的微生物16S扩增子数据分析的装置主要包括如下模块：数据获得模块；数据质控分析模块；OTU聚类及物种注释模块；α‑多样性分析模块；β‑多样性分析模块；组间差异显著性分析模块。本发明所提供的装置通过分析不同样本分组之间和或样本内微生物16S区域的序列变异和丰度，可应用于分析研究环境微生物中细菌或古菌的群落结构多样性。

主权项：1.微生物16S扩增子数据分析的装置，其特征在于：所述装置包括如下模块：1数据获得模块：用于获取所有待测样本的微生物16S扩增子的原始数据；2数据质控分析模块：用于将所述原始数据进行质量控制得到有效数据；3OTU聚类及物种注释模块：用于获得所有待测样本的物种组成及丰度信息；所述OTU聚类及物种注释模块包括如下模块：3-1OTU聚类及物种注释模块：用于将所述所有待测样本的所述有效数据聚类成OTUs，并对OTUs的代表序列进行物种注释；3-2物种分布分析模块：用于分析所述所有待测样本在不同分类水平上的物种相对丰度及比例；3-3物种进化树构建模块：用于构建所述所有待测样本的属水平物种进化树，用于分析属水平物种的系统进化关系；4α-多样性分析模块：用于分析所述所有待测样本内的微生物群落多样性；所述α-多样性分析模块包括如下模块：4-1α-多样性指数统计模块：用于统计所述所有样本的α-多样性分析指数；4-2物种多样性曲线绘制模块：用于绘制所述所有待测样本的物种多样性曲线，以分析所述有效数据的数据量的合理性和所述样本中物种的丰富度和均匀度；5β-多样性分析模块：用于比较分析所述所述所有待测样本间的微生物群落构成；所述β-多样性分析模块包括如下模块：5-1β-多样性指数统计模块：用于统计所述所有待测样本间的β-多样性指数；5-2排序分析模块：用于在可视化的低维空间展示多维数据的结构；5-3聚类分析模块：用于通过对待测样本进行聚类分析，获得所述所有待测样本间的相似性分析结果；6组间差异显著性分析模块：用于分析获得待测样本分组组间差异的显著性。

全文数据：

权利要求：

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