申请/专利权人：北京大学

申请日：2023-09-12

公开（公告）日：2024-04-02

公开（公告）号：CN117802209A

主分类号：C12Q1/6869

分类号：C12Q1/6869

优先权：["20220930 CN 2022112083669"]

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2024.04.19#实质审查的生效;2024.04.02#公开

摘要：一种高灵敏度的检测染色质状态和基因组信息的方法，包括：染色质转座步骤，使用转座酶对一个或以上的细胞或细胞核的染色质进行转座从而获得基因组DNA片段，同时在片段两端加上标签；富集步骤，使用片段筛选或PCR扩增富集长度大于700核苷酸对的长片段DNA；测序步骤，用第三代测序平台对富集获得的长片段DNA进行测序；分析步骤，对测序得到的数据进行分析，同时获得染色质状态和基因组信息。相比现有ATAC‑seq技术所得数据局限于宽松的染色质开放区域至少宽于数十核苷酸对的区域信息，本发明通过测序长片段DNA，可在低至单个细胞的样本中同时获取包括杂合单核苷酸多态性、基因组结构、重复序列等基因组信息，以及较狭窄的染色质开放区域信息。

主权项：1.一种检测染色质状态和基因组信息的方法，其特征在于，包括下列步骤：步骤一、用转座酶对一个或一个以上的细胞或细胞核样本的染色质进行切割，从而获得带标签的基因组DNA片段；步骤二、富集带标签的长基因组DNA片段，所述长基因组DNA片段是指长度大于700核苷酸对的片段；步骤三、将所富集的带标签的长基因组DNA片段在第三代测序平台上机测序；步骤四、对测序得到的数据进行计算机分析，通过将所述长基因组DNA片段回帖至基因组区域获得片段信息，并根据所述片段信息获得所述样本在所述基因组区域的染色质状态和基因组信息。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 北京大学 一种高灵敏度的检测染色质状态和基因组信息的方法

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