申请/专利权人:华南农业大学
申请日:2023-05-26
公开(公告)日:2024-04-16
公开(公告)号:CN117894369A
主分类号:G16B20/50
分类号:G16B20/50;C12N15/29;C12N15/82;A01H5/00;A01H6/46;G16B50/00;G16B25/20
优先权:
专利状态码:在审-公开
法律状态:2024.04.16#公开
摘要:本发明公开了一种基于选择性清除SNP引导的植物环境适应性候选基因的筛选方法,先对不同环境适应性的植物品种进行比较基因组选择性清除分析,获得该植物环境适应性分化相关的选择性清除SNP位点的基因组学数据;再将获得的植物基因组SSNP信息与植物QTL数据库中环境适应性分化相关QTLs初步定位染色体区间的信息结合,即可快速筛选到与环境适应性相关的候选基因。相较于传统的图位克隆,本发明能快速确定植物环境适应性基因,实效性高。本发明同时为植物生态环境适应性差异下非生物胁迫的分子育种提供新思路。
主权项:1.一种基于选择性清除SNP引导的植物环境适应性候选基因的筛选方法,其特征在于,包括如下步骤:S1.对不同环境适应性的植物品种进行比较基因组选择性清除分析,获得该植物环境适应性分化相关的选择性清除SNP位点的基因组学数据;S2.将获得的植物环境适应性分化相关的选择性清除SNP位点信息与该植物QTL数据库中环境适应性分化相关QTLs初步定位染色体区间的SNP基因型信息结合,若在QTL区间内也存在该SNP位点,则该SNP位点所在基因即为候选基因。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 华南农业大学 基于选择性清除SNP引导的植物环境适应性候选基因的筛选方法
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