申请/专利权人：贝克顿迪金森公司

申请日：2022-08-31

公开（公告）日：2024-04-19

公开（公告）号：CN117916389A

主分类号：C12Q1/6841

分类号：C12Q1/6841

优先权：["20210901 US 63/239,897"]

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2024.05.07#实质审查的生效;2024.04.19#公开

摘要：本文公开的内容包括用于确定样品中靶例如，核酸靶、细胞组分靶的空间位置和拷贝数的系统、方法、组合物和试剂盒。在一些实施方案中，提供了包含多于一个空间区域的基底。多于一种寡核苷酸条形码可以与空间区域中的每一个关联，并且可以包含预定空间标记。相同空间区域的寡核苷酸条形码可以包含相同的空间标记，并且不同空间区域的寡核苷酸条形码可以包含不同的空间标记。该方法可以包括使基底与样品接触，使得每个不同的空间区域接触样品的不同空间位置。该方法可以包括寡核苷酸条形码的原位延伸例如，逆转录。

主权项：1.一种用于确定样品中核酸靶的空间位置和拷贝数的方法，包括：提供包含多于一个空间区域的基底，其中多于一种寡核苷酸条形码与所述空间区域中的每一个关联，其中所述寡核苷酸条形码中的每一个包含通用序列、分子标记、能够与核酸靶杂交的靶结合区和预定空间标记，其中相同空间区域的寡核苷酸条形码包含相同的空间标记，并且其中不同空间区域的寡核苷酸条形码包含不同的空间标记；使所述基底与包含核酸靶的拷贝的样品接触，其中所述接触包括使所述多于一个空间区域与所述样品接触，使得每个不同的空间区域接触所述样品的不同空间位置；使与所述核酸靶的拷贝杂交的所述多于一种寡核苷酸条形码延伸以产生多于一个条形码化核酸分子，所述多于一个条形码化核酸分子各自包含与所述核酸靶的至少一部分互补的序列；获得测序数据，所述测序数据包括所述多于一个条形码化核酸分子或其产物的多于一个测序读段，其中所述多于一个测序读段中的每一个包含空间标记序列、分子标记序列和所述核酸靶的子序列；并且对于每个独特的空间标记序列，其与所述基底的不同空间区域关联，并且从而与所述样品的不同空间位置关联，计数具有与核酸靶关联的不同序列的分子标记的数量，以确定在所述样品的每个空间位置处所述核酸靶的拷贝数。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 贝克顿迪金森公司 使用原位逆转录的空间多组学

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