申请/专利权人：深圳市真迈生物科技有限公司

申请日：2023-12-29

公开（公告）日：2024-04-19

公开（公告）号：CN117912550A

主分类号：G16B20/30

分类号：G16B20/30;G16B20/20;G16B40/10;G06N20/00

优先权：

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2024.05.07#实质审查的生效;2024.04.19#公开

摘要：本申请涉及确定读段质量的方法，其包括：获取边合成边测序的读段，读段由读取轮数据和轮空轮数据构成，读段的读取轮数据反映对应于图像集的指定位置的模板上存在碱基延伸信号、轮空轮数据反映对应于图像集的指定位置的模板上不存在碱基延伸信号，图像集包括测序运行期间的一轮或多轮测序产生的、包含指定位置及其周围背景信号的多个图像；基于图像集、读取轮数据和轮空轮数据的信息，确定预定特征组合中每个特征的值；基于预定特征组合中的特征的值和预先训练的预测模型，预测读段被分类为指定类别读段的概率；基于所述概率，确定读段的测序质量。通过采用上述确定读段质量的方法，能够有效地对单分子双色测序的读段进行质量评价。

主权项：1.一种确定读段质量的方法，其特征在于，包括：获取来自基于芯片成像检测、对芯片上的模板进行边合成边测序的读段，所述读段由读取轮数据和轮空轮数据构成，所述读段的读取轮数据反映对应于图像集的指定位置的模板上存在碱基延伸信号、所述轮空轮数据反映对应于所述图像集的所述指定位置的模板上不存在碱基延伸信号，所述图像集包括测序运行期间的一轮或多轮测序产生的、包含所述指定位置及其周围背景信号的多个图像；基于所述图像集、所述读取轮数据和所述轮空轮数据中的至少一类信息，确定预定特征组合中每个特征的值，所述预定特征组合中的每个特征为与该读段的产生有关的、可量化的特征；基于所述预定特征组合中的特征的值和预先训练的预测模型，预测所述读段被分类为指定类别读段的概率；和基于所述概率，确定所述读段的测序质量，所述预先训练的预测模型为能够基于读段的预定特征组合中的特征的值计算该读段属于指定类别读段的概率的分类器，所述读段的质量得分与该读段被分类为指定类别读段的概率正相关。

全文数据：

权利要求：

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