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申请/专利权人：石河子大学
申请日：2024-02-20
公开（公告）日：2024-04-26
公开（公告）号：CN117936111A
主分类号：G16H50/70
分类号：G16H50/70;G16H50/30;G16B20/30;G16B25/10;G06N20/00
优先权：
专利状态码：在审-实质审查的生效
法律状态：2024.05.14#实质审查的生效;2024.04.26#公开
摘要：本发明涉及一种生物信息技术领域，是一种肝细胞癌预后评分模型构建方法、装置、设备及存储介质，包括：构建训练集和验证集；利用训练集对机器学习算法集合中的所有组合进行训练，获得对应的预后评分模型；利用验证集对所有预后评分模型进行验证，输出指数平均值最高的预后评分模型作为最优预后评分模型。本发明基于RNA测序数据和机器学习，从免疫浸润和免疫相关预后基因方面构建预后评分模型，提高了后续训练出模型的评分效能，并且机器学习时是对若干不同组合的算法集合进行模型训练及筛选，进一步提高了预后评分的有效性及准确性，使其能够为免疫浸润在肝癌预后与耐药性方面的影响提供准确的数据参考。
主权项：1.一种肝细胞癌预后评分模型构建方法，其特征在于，包括：构建训练集和验证集，其中训练集包括利用单因素COX分析从TCGA-LIHC数据集中筛选出的免疫相关预后基因，验证集包括GSE14520、GSE7642和ICGC-LIRI-JP数据集；利用训练集对机器学习算法集合中的所有组合进行训练，获得对应的预后评分模型，其中机器学习算法集合包括LASSO、逐步Cox、弹性网络、CoxBoost、RSF、Ridge、监督主成分、广义增强回归建模、Cox的偏最小二乘回归和生存支持向量机；利用验证集对所有预后评分模型进行验证，输出指数平均值最高的预后评分模型作为最优预后评分模型。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 石河子大学 肝细胞癌预后评分模型构建方法、装置、设备及存储介质
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