申请/专利权人：宜宾五粮液股份有限公司;江南大学

申请日：2024-01-24

公开（公告）日：2024-04-26

公开（公告）号：CN117925872A

主分类号：C12Q1/689

分类号：C12Q1/689;C12Q1/6895

优先权：

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2024.05.14#实质审查的生效;2024.04.26#公开

摘要：本发明属于基因工程技术领域，具体涉及大曲微生物总RNA指纹图谱、构建方法及其应用。针对目前还未见基于宏转录组分析方法构建大曲微生物RNA指纹图谱的报道，本发明通过：a、大曲总RNA的提取；b、样品检测与质控；c、质控合格样品进行RNA打断、cDNA合成、末端修复、接头连接、文库检测；d、环化制备与测序；e、原始数据过滤，获得高质量数据；f、宏转录组Denovo组装；g、基因集功能注释；h、大曲微生物RNA指纹图谱分析等步骤获得大曲微生物总RNA指纹图谱，并将其应用于准确揭示大曲活性微生物功能及代谢途径。

主权项：1.大曲微生物总RNA指纹图谱的构建方法，其特征在于：基于宏转录组分析方法构建，包括以下步骤：a、大曲总RNA的提取：将大曲粉置于裂解液中，离心，吸取上清液；然后加入有机溶剂洗涤，洗涤后得大曲总RNA；b、样品检测与质控：对步骤a中的大曲总RNA进行浓度和质量测定，浓度≥0.1ngμL，RNA总量≥0.1μg，A260A280在1.8～2.2之间即为合格；c、对步骤b中质控合格样品进行RNA打断、cDNA合成、末端修复、接头连接、文库检测；d、对步骤c中处理后的样品进行环化制备与测序；e、对步骤d的原始测序数据过滤杂质，获得高质量数据，包括以下至少一项处理：1剔除含有≤10％N碱基的Reads；2剔除含有15个碱基及以上区域比对到接头序列的Reads；3剔除含有40％以上的Q20的低质量碱基的Reads；4去除比对上宿主基因组的序列；f、宏转录组Denovo组装：针对每个样品经步骤e处理得到的CleanReads，使用拼接软件分别进行从头组装；g、基因集功能注释：对步骤f组装后的基因序列进行基因集功能注释；h、大曲微生物RNA指纹图谱分析：根据基因集功能注释结果绘制大曲微生物RNA指纹图谱，并根据图谱进行微生物相关信息分析。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 宜宾五粮液股份有限公司;江南大学 大曲微生物总RNA指纹图谱、构建方法及其应用

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