申请/专利权人：中国农业科学院北京畜牧兽医研究所

申请日：2023-12-18

公开（公告）日：2024-04-26

公开（公告）号：CN117925847A

主分类号：C12Q1/6888

分类号：C12Q1/6888;G16B25/10;A61D19/02

优先权：

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2024.05.14#实质审查的生效;2024.04.26#公开

摘要：本发明涉及生物技术领域，具体公开了一种绵羊脂尾单细胞转录组图谱及其构建方法与应用。本发明图谱构建方法包括：同时采集绵羊尾脂沉积发生前后不同胚胎发育阶段尾组织样品，制备为单细胞悬液；捕获单个细胞，进行细胞裂解、cDNA合成、cDNA文库质检，构建测序文库，进行上机测序；与参考基因组比对，获得原始比对数据和基因在各细胞表达量矩阵；基于各细胞捕获的mRNA数量和线粒体基因比例进行细胞质控；移除少于10个细胞中表达的基因；进行双细胞预测及过滤，合并质控后的各时期样本获得基因‑细胞表达矩阵；进行数据预处理；基于不同细胞类型已知标记基因进行细胞注释。本发明为单细胞转录组测序技术在脂肪生成相关研究领域的应用具有重要借鉴意义。

主权项：1.一种构建绵羊脂尾单细胞转录组图谱的方法，其特征在于，包括：1同时采集绵羊尾脂沉积发生前后不同胚胎发育阶段尾组织样品，分别制备为单细胞悬液；2捕获所述单细胞悬液中的单个细胞，进行细胞裂解、cDNA合成、cDNA文库质检、片段化和末端修复后，构建测序文库，进行上机测序获得原始测试数据；3将所述原始测试数据与参考基因组比对，获得原始比对数据和基因在各细胞表达量矩阵；4基于各细胞捕获的mRNA数量和线粒体基因比例进行细胞质控；移除在少于10个细胞中表达的基因；进行双细胞预测及过滤，获得质控后的各时期样本，将所述质控后的各时期样本进行合并，获得质控后的基因-细胞表达矩阵用于下游分析；5对质控后的所述基因-细胞表达矩阵进行数据预处理；6基于不同细胞类型已知标记基因进行细胞注释，构建获得绵羊脂尾单细胞转录组图谱。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 一种绵羊脂尾单细胞转录组图谱及其构建方法与应用

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