申请/专利权人：沈阳化工大学

申请日：2021-03-24

公开（公告）日：2024-04-26

公开（公告）号：CN113178226B

主分类号：G16B15/30

分类号：G16B15/30;G16C20/50;G16C10/00;G16C20/90

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.04.26#授权;2021.08.13#实质审查的生效;2021.07.27#公开

摘要：一种金樱子三萜类化合物抗阿尔茨海默症的方法，涉及一种生物化合物抗阿尔茨海默症的方法，通过在线数据库或网站分析获得金樱子药理靶点及阿尔茨海默症病原靶点，随后利用软件将所收集到的化合物由2D转化为对应的3D结构；进行分子对接，筛选对接结果良好的化合物并保存；得到药物‐疾病交集靶基因靶点并构建相关蛋白互作网络筛选核心靶点；利用R语言相关包对核心靶点进行基因本体GO生物过程和KEGG通路富集分析；构建药物‐靶点‐疾病通路图进行治疗机制的深入解析，通过体外活性验证进一步确认网络药理学的真实性。本发明旨在为研究阿尔茨海默症提供了新思路，同时为金樱子三萜类化合物用于阿尔兹海默症的临床应用提供了前期研究基础。

主权项：1.一种基于网络药理学分析金樱子中三萜类化合物抗阿尔茨海默症作用机制的方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：S1：金樱子三萜类化合物筛选以“金樱子三萜类化合物”为关键词于TCMSP数据库并在知网平台查阅文献参阅搜索，筛选出三萜类化合物并得到金樱子中分离出的化合物结构，利用软件画出所有化合物的2D结构，然后将从金樱子中分离得到的化合物复制粘贴到3D软件中，将其转化为3D结构并保存为mol2格式；S2：阿尔兹海默症候选靶点筛选以“阿尔兹海默症”为关键词，在Drugbank、uniport、RCSBPDB、OMIM数据库进行检索，选择分辨率在3.00Å以下，阿尔兹海默症，人源，含有配体条件对蛋白进一步筛选，所述的配体不能是离子，最后将满足这些条件的蛋白进行下载并予以保存；S3：分子对接利用开源软件，依次将S2中得到的阿尔兹海默症蛋白与S1中得到的所有小分子化合物进行对接，打分；将score5为结合具有显著性；并且将筛选后的化合物分别保存到相应文档；S4：构建金樱子三萜类化合物靶点-阿尔兹海默症靶点网络及筛选核心靶点运用STRING数据库分析S3筛选出的化合物，得到靶点蛋白网络关系图，运用Cytoscape软件导入交集靶点，得到C-T网络，筛选符合条件的核心靶点进行下一步分析；S5：对核心靶点富集分析以探讨药物成分作用机制应用R语言的“ClusterProfiler”、“ReactomePA”，R包对S4的核心靶点进行基因本体GO生物过程和KEGG通路富集注释分析，输出其相应的气泡图和柱状图，预测靶点的功能分布，并根据富集因子分析核心通路富集程度，得到关键核心靶点参与的关键通路信息，从而解析金樱子三萜类化合物-阿尔茨海默症的作用机制；S6：“成分-靶点-疾病通路”网络构建采用Cytoscape软件构建金樱子三萜类化合物抗AD的“成分-靶点-疾病”网络图，以呈现金樱子如何通过“多靶点、多途径、多层次”整合调控发挥药效；S7：进行体外活性验证通过直接靶标实验，神经细胞保护活性验证，分子动力学模拟进一步验证通过网络药理学筛选出金樱子抗阿尔兹海默症的关键化合物和核心靶蛋白的真实性。

全文数据：

权利要求：

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