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【发明公布】基于序列同源性的特定生物序列预测方法及其系统_电子科技大学长三角研究院(衢州)_202410326309.3 

申请/专利权人:电子科技大学长三角研究院(衢州)

申请日:2024-03-21

公开(公告)日:2024-04-30

公开(公告)号:CN117953973A

主分类号:G16B30/10

分类号:G16B30/10;G16B40/00

优先权:

专利状态码:在审-实质审查的生效

法律状态:2024.05.17#实质审查的生效;2024.04.30#公开

摘要:本发明提供了一种基于序列同源性的特定生物序列预测方法及其系统,包括,准备特定生物序列相关的原始序列数据集;原始序列数据集包括训练集和测试集,训练集用于训练模型,测试集则用于对训练的模型进行测试;构造基于序列同源性评分的模糊隶属函数,用于将序列数据转化成特征向量;构造深度模糊回声状态网络,用于根据特征向量输出预测结果;使用原始序列数据集训练深度模糊回声状态网络。本方案提出基于序列同源性评分的模糊隶属函数将序列数据转化成特征向量,无需手动提取特征,并且可直接处理字符串序列,无需进行特征编码,通过整合序列进化信息有效优化特征空间,不仅减少了模型的训练时间,同时提高了模型的分类性能。

主权项:1.一种基于序列同源性的特定生物序列预测方法,其特征在于,该方法包括:准备特定生物序列相关的原始序列数据集;构造基于序列同源性评分的模糊隶属函数,用于将序列数据转化成特征向量;构造深度模糊回声状态网络,用于根据所述的特征向量输出预测结果;使用所述的原始序列数据集训练所述的深度模糊回声状态网络。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 电子科技大学长三角研究院(衢州) 基于序列同源性的特定生物序列预测方法及其系统

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