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【发明公布】变体核酸样本背景水平的评估方法_广州燃石医学检验所有限公司_202311849925.9 

申请/专利权人:广州燃石医学检验所有限公司

申请日:2021-12-24

公开(公告)日:2024-04-30

公开(公告)号:CN117947163A

主分类号:C12Q1/6886

分类号:C12Q1/6886;C12Q1/6869;C12N15/11;G16B20/50;G16B30/10

优先权:

专利状态码:在审-实质审查的生效

法律状态:2024.05.17#实质审查的生效;2024.04.30#公开

摘要:本申请涉及一种变体核酸的检测方法,具体涉及一种检测变体核酸的存在和或数量方法,所述方法包含基于待测样本中的体细胞突变区域和背景突变区域,确定所述变体核酸存在和或数量。本申请还涉及本申请的方法在样本检测中的应用。

主权项:1.一种变体核酸样本背景水平的评估方法,包括:数据准备,包括基于特异性分子标签UMI校正待测样本的测序数据中的碱基错误,并将校正后的读长reads比对到人类参考基因组;基于所述校正后的读长的比对结果,计算并得到所述变体核酸样本的背景水平,其中,所述背景水平包括样本特异性SNV背景水平和或样本特异性InDel背景水平。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 广州燃石医学检验所有限公司 变体核酸样本背景水平的评估方法

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