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【发明授权】一种三阴型乳腺癌预后风险评估系统_中山大学孙逸仙纪念医院_202311341019.8 

申请/专利权人:中山大学孙逸仙纪念医院

申请日:2023-10-17

公开(公告)日:2024-04-30

公开(公告)号:CN117373534B

主分类号:G16B25/10

分类号:G16B25/10;G16B40/20;G16H50/30

优先权:

专利状态码:有效-授权

法律状态:2024.04.30#授权;2024.01.26#实质审查的生效;2024.01.09#公开

摘要:本发明提供了一种三阴型乳腺癌预后风险评估系统,包括:基因信息获取模块以及评估模块;基因信息获取模块用于获取待检测患者所对应的选定基因对的基因表达信息;其中,所述选定基因对包括:GPI‑SRGN、ANKRD22‑PPDPF、ANKRD37‑CORO1A、ANKRD37‑GBP4、GBP4‑NFIC以及GBP5‑NFIC;评估模块用于根据所述选定基因对的基因表达信息以及预设的预后风险模型,确定所述待检测三阴型乳腺癌患者的预后风险评估结果。通过使用所述三阴型乳腺癌预后风险评估系统,仅需要计算每一位患者样本中的6个基因对的相对表达值,且将计算所得的值代入评分公式计算得到最终评分,即可有效预测三阴型乳腺癌患者预后风险高、低,辅助临床治疗决策个性化制定。

主权项:1.一种三阴型乳腺癌预后风险评估系统,其特征在于,包括:亚群识别模块、基因对生成模块、选定基因确定模块、基因信息获取模块以及评估模块;所述亚群识别模块,用于提取三阴型乳腺癌患者所对应的若干细胞亚群,并从所述细胞亚群中,识别出与三阴型乳腺癌生存结局事件即死亡事件的负相关亚群N群和正相关亚群P群;其中,N群细胞具有三阴型乳腺癌预后良好的生物学特征,P群细胞具有三阴型乳腺癌预后不良的生物学特征;所述基因对生成模块,用于将N群和P群细胞的特征差异基因进行单因素分析,筛选出能表征三阴型乳腺癌的特征差异基因,并根据筛选后的特征差异基因组合成若干基因对;所述选定基因确定模块,用于通过LASSO算法从所有基因对中筛选出所述选定基因对;所述基因信息获取模块,用于获取待检测患者所对应的选定基因对的基因表达信息;其中,所述选定基因对包括:GPI-SRGN、ANKRD22-PPDPF、ANKRD37-CORO1A、ANKRD37-GBP4、GBP4-NFIC以及GBP5-NFIC;所述评估模块,用于根据所述选定基因对的基因表达信息以及预设的预后风险模型,确定所述待检测患者的三阴型乳腺癌预后风险评估结果;其中,所述预后风险模型为:预后风险评分=PGPI-SRGN*a+PANKRD22-PPDPF*b+PANKRD37-CORO1A*c+PANKRD37-GBP4*d+PGBP4-NFIC*e+PGBP5-NFIC*f;PA-B的数值根据A-B基因对的基因表达信息确定,当A基因相较于B基因为高表达时,PA-B=1,反之PA-B=0;其中,A-B基因对包括:GPI-SRGN、ANKRD22-PPDPF、ANKRD37-CORO1A、ANKRD37-GBP4、GBP4-NFIC以及GBP5-NFIC;所述a、b、c、d、e、f为预设常数值。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 中山大学孙逸仙纪念医院 一种三阴型乳腺癌预后风险评估系统

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