龙图腾网&IPTOP
- 微信扫码登录
- 账号密码登录
- 短信登录/注册
申请/专利权人：中山大学附属第五医院;南方海洋科学与工程广东省实验室(珠海)
申请日：2020-12-07
公开（公告）日：2024-05-07
公开（公告）号：CN112786105B
主分类号：G16B20/00
分类号：G16B20/00;G16B50/00
优先权：
专利状态码：有效-授权
法律状态：2024.05.07#授权;2021.05.28#实质审查的生效;2021.05.11#公开
摘要：本发明属于生物技术领域，公开了一种以半胰蛋白酶多肽为中心的宏蛋白质组数据挖掘方法，包括两步搜库、从头测序、开放式检索和多种搜库软件匹配，针对高分辨率质谱数据进行大规模的以半胰蛋白酶肽为中心的宏蛋白质组信息挖掘。这些策略可以减少因数据库不完整和翻译后修饰而产生的假阳性率。使用本发明的方法在分析大肠杆菌蛋白质组时，从一个巨大的宏蛋白数据库中鉴定出的肽段有93.4％与传统大肠杆菌参考数据库鉴定出的肽段相一致。
主权项：1.一种确定肠道微生物蛋白质水解程度的方法，其特征在于，包括以下步骤：S1、获取样品的宏蛋白质组数据或公共数据库中发表的宏蛋白质组数据；S2、利用大的宏蛋白数据库以及PEAKSDB软件执行第一次搜索，得到至少一个肽被鉴定出来的蛋白质；S3、利用PEAKSDB软件、MaxQuant软件和pFind软件将组学数据与S2得到的蛋白质序列进行搜库鉴定，保留被PEAKSDB、MaxQuant和pFind三种软件同时鉴定的肽；S4、区分出S3得到的肽中半胰蛋白酶多肽和完全胰蛋白酶多肽；S5、以半胰蛋白酶多肽归一化后的相对丰度来确定蛋白质水解程度，其中，半胰蛋白酶多肽归一化的相对丰度是通过将半胰蛋白酶多肽的相对丰度归一化到完全胰蛋白酶多肽的相对丰度得到；S4中，半胰蛋白酶多肽的鉴定原则是：鉴定的肽段若前一位氨基酸不是R或K，不包括蛋白质N端肽段，则是半胰蛋白酶N末端肽，鉴定的肽段若最后一位氨基酸不是R或K，不包括蛋白质C端肽段，则是半胰蛋白酶C末端肽；根据洗脱时间将源内片段与蛋白水解衍生的半胰蛋白酶多肽区分开来。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 中山大学附属第五医院;南方海洋科学与工程广东省实验室(珠海) 一种宏蛋白质组挖掘方法及其在获取肠道微生物蛋白水解特征中的应用
免责声明
1、本报告根据公开、合法渠道获得相关数据和信息，力求客观、公正，但并不保证数据的最终完整性和准确性。
2、报告中的分析和结论仅反映本公司于发布本报告当日的职业理解，仅供参考使用，不能作为本公司承担任何法律责任的依据或者凭证。
主营中国专利交易买卖与专利转让许可,高校科技成果推广与科技成果转化,知识产权运营管理与平台开发,科技人才专家库与科技猎头等科技服务
开放平台
担保交易
惠及多方
会员特惠
专属平台
适合多方
数据共享
功能齐全
皖公网安备 34010402703815号