申请/专利权人:杭州联川生物技术股份有限公司
申请日:2024-03-19
公开(公告)日:2024-05-10
公开(公告)号:CN118006732A
主分类号:C12Q1/6806
分类号:C12Q1/6806;C40B50/06;C40B80/00
优先权:
专利状态码:在审-实质审查的生效
法律状态:2024.05.28#实质审查的生效;2024.05.10#公开
摘要:本发明公开了一种cfDNA甲基化NGS文库的构建方法:重亚硫酸盐处理后的cfDNA单链,利用末端转移酶以NTP为底物,在单链3’端加上2‑4个ATP尾;以T4RNA连接酶在单链3’端连接单链接头;以二链合成引物,利用taqDNA聚合酶进行二链合成,在合成末端多加一个A碱基;利用DNA连接酶,以TA克隆的方式连接双链接头;利用建库index引物进行PCR扩增构建文库。该方法先转化后建库,避免l传统先建库后转化DNA断裂后造成大量数据丢失的问题,同时采用单链和双链两种接头连接方式,规避了普通单链建库需要采用随机引物合成的步骤,既避免了随机引物不可从头合成的问题,又避免了随机引物合成的偏好性。
主权项:1.一种cfDNA甲基化NGS文库的构建方法,其特征在于,包括如下步骤:1重亚硫酸盐处理后的cfDNA单链,利用末端转移酶以NTP作为底物,在单链3’端加上2-4个ATP尾;2以T4RNA连接酶在单链3’端进行单链接头连接;3以二链合成引物,利用taqDNA聚合酶进行二链合成,并在合成末端多加一个A碱基;4利用DNA连接酶,以TA克隆的方式进行双链接头的连接;5利用建库index引物进行PCR扩增构建文库。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 杭州联川生物技术股份有限公司 一种用于构建cfDNA甲基化NGS文库的试剂盒和方法
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