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申请/专利权人:浙江大学医学院附属第四医院
摘要:本发明涉及一种子宫内膜细胞比例预测种植窗模型的建立方法,包括对子宫内膜单细胞数据集进行整合;根据主成分对子宫内膜单细胞数据集进行非监督性聚类,获得不同月经周期阶段人子宫图谱;利用反卷积算法建立人子宫组织细胞组成签名矩阵;将所有类型细胞的细胞比例作为变量,确定预测种植窗的独立预测因子,根据独立预测因子构建子宫内膜细胞比例预测种植窗模型。通过本方法构建的子宫内膜细胞比例预测种植窗模型,使得可以通过检测子宫内膜特定细胞类型比例,预测辅助生殖患者处于WOI阶段的概率,更好的指导胚胎植入时机。利用子宫内膜的细胞生物学特征,在提高准确性的同时,大大降低成本,使得子宫内膜WOI阶段预测应用更加广泛。
主权项:1.一种子宫内膜细胞比例预测种植窗模型的建立方法,其特征在于,包括下述步骤:S1:检索GEO数据库中可育女性的不同月经周期阶段子宫内膜单细胞数据集,将子宫内膜单细胞数据集解析为基因-细胞表达矩阵,并对子宫内膜单细胞数据集进行整合;S2:对整合后的子宫内膜单细胞数据集进行数据标准化,选择表达量变异较大的基因,进行数据归一化,进而对归一化的子宫内膜单细胞数据集进行主成分分析,筛选具有显著意义的主成分所包含的基因;S3:根据主成分对子宫内膜单细胞数据集进行非监督性聚类,聚类成不同的特征亚群,寻找每个特征亚群的特异表达标志物,获得不同月经周期阶段人子宫图谱;S4:将人子宫图谱每个特征亚群的特异表达标志物作为基因集,利用反卷积算法建立人子宫组织细胞组成签名矩阵;S5:利用人子宫组织细胞组成签名矩阵,将所有类型细胞的细胞比例作为变量,通过Logistic回归分析确定预测种植窗的独立预测因子,根据独立预测因子构建子宫内膜细胞比例预测种植窗模型。
全文数据:
权利要求:
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