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申请/专利权人：石河子大学
申请日：2024-01-15
公开（公告）日：2024-05-10
公开（公告）号：CN118006745A
主分类号：C12Q1/6869
分类号：C12Q1/6869;C12Q1/6888;C12Q1/6806;C40B50/06;G16B20/30;G16B30/10
优先权：
专利状态码：在审-实质审查的生效
法律状态：2024.05.28#实质审查的生效;2024.05.10#公开
摘要：本发明涉及基因检测技术领域，公开了基于DNA甲基化高通量测序的奶牛早期妊娠的检测方法，包括S1、实验动物选取；S2、样本采集；S3、RNA和DNA的提取及纯度测定；S4、RNA测序；S5、RRBS甲基化测序；S6、富集分析。本发明以早孕相关基因DNA甲基化作为早孕指示因子，可真正做到早孕检测；核酸检测技术灵敏快捷，适合对集约化养殖奶牛进行早早孕检测；DNA检测具有较大优势，其分子性质相对稳定易于运输保存；检测技术更为简单，成本更低等。
主权项：1.基于DNA甲基化高通量测序的奶牛早期妊娠的检测方法，其特征在于，包括以下步骤：S1、实验动物选取：选取妊娠30天的3头奶牛作为实验组和未妊娠的3头奶牛作为对照组，两组奶牛的个体、毛色、年龄相近；S2、样本采集：采集实验组和对照组奶牛的外周血液后，立即冷冻保存；S3、RNA和DNA的提取及纯度测定，纯度测定完成后分析DNA降解程度以及RNA或蛋白质污染程度；S4、RNA测序：使用高质量的RNA构建文库，文库构建完成后，把不同文库按照有效浓度及目标下机数据量的需求进行组装；通过高通量测序仪测量测序片段，得到图像数据，通过CASAVA碱基识别转化图像数据得到序列数据，使用hisat2软件将有效数据与参考基因组进行比对；最后利用DESeq2软件对各组样品进行差异基因的分析；S5、RRBS甲基化测序；S6、富集分析：使用R包clusterProfile的方法对GO功能和KEGG通路的富集分析，得到差异基因功能富集的情况，当P值小于0.05时，认为GO或者是KEGG功能有显著的富集情况。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 石河子大学 基于DNA甲基化高通量测序的奶牛早期妊娠的检测方法
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2、报告中的分析和结论仅反映本公司于发布本报告当日的职业理解，仅供参考使用，不能作为本公司承担任何法律责任的依据或者凭证。
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