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申请/专利权人：华中科技大学
申请日：2024-01-10
公开（公告）日：2024-05-17
公开（公告）号：CN118053493A
主分类号：G16B15/00
分类号：G16B15/00;G16B40/00
优先权：
专利状态码：在审-实质审查的生效
法律状态：2024.06.04#实质审查的生效;2024.05.17#公开
摘要：本发明公开了一种从冷冻电镜图中构建RNA三维结构的方法、装置和电子设备，属于生物大分子结构测定技术领域，所述方法包括：将当前冷冻电镜图输入第一深度神经网络和第二深度神经网络，分别得到当前原子概率图和当前核苷酸类型，无需依赖大量人力资源，节约人工成本的同时提高了执行效率；利用当前原子概率图确定各个骨架原子的位置并构建成主链路径，进一步地结合当前RNA序列以及当前核苷酸类型对其进行主链路径评分，可以滤除冗余主链路经，降低后续数据整合的计算复杂度；对评分靠前的进行骨架原子添加、模板核苷酸叠合以及螺旋结构优化，且最终得到的RNA三维结构的构建高度依赖与之对应的当前冷冻电镜图和当前RNA序列、精度较高。
主权项：1.一种从冷冻电镜图中构建RNA三维结构的方法，其特征在于，包括：S1：将当前冷冻电镜图输入第一深度神经网络和第二深度神经网络，分别得到当前原子概率图和当前核苷酸类型；S2：从所述当前原子概率图中确定出各种骨架原子的位置，以构建多条连接P原子和C4'原子的主链路径；S3：将所述当前冷冻电镜图对应的当前RNA序列分配到各个所述主链路径中，并结合所述当前核苷酸类型对各个所述主链路径与所述当前RNA序列之间的匹配程度进行评分；S4：针对评分靠前的多个所述主链路径，在每个所述主链路径中的每个C4'原子处添加距离最近的N1N9原子和P原子构成当前核苷酸的三原子；再将模板核苷酸叠合到各个当前核苷酸上得到粗略全原子结构；S5：将所述粗略全原子结构中标记配对成功的核苷酸对进行螺旋结构优化，最终得到RNA三维结构。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 华中科技大学 从冷冻电镜图中构建RNA三维结构的方法、装置和电子设备
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