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申请/专利权人：中科计算技术西部研究院
申请日：2024-02-18
公开（公告）日：2024-05-17
公开（公告）号：CN118053495A
主分类号：G16B20/00
分类号：G16B20/00;G06N3/063
优先权：
专利状态码：在审-实质审查的生效
法律状态：2024.06.04#实质审查的生效;2024.05.17#公开
摘要：本发明公开了一种加速碱基识别的测序和分析系统及碱基识别装置，属于生物极影数据处理领域，用以实现高吞吐量、高能效地碱基识别。本发明利用CPU控制流量池对输入的基因组进行测序；流量池将基因组测序为电信号并写入DRAM；CPU获取DRAM中的电信号，利用高速缓存内碱基识别架构进行碱基识别。该架构包括碱基识别控制器和碱基识别缓存。碱基识别控制器接收并解析CPU内核的指令，在该指令指示执行加速模式的情况下，根据预配置的分区表，选择碱基识别缓存中相应的缓存阵列来执行碱基识别计算。本发明通过增强测序仪中CPU的缓存来实现碱基识别的计算加速，通过引入高速缓存，将瓶颈操作卸载到高速缓存运算中，可承担15台测序仪的测序吞吐量。
主权项：1.一种加速碱基识别的测序和分析系统，包括流动池、DRAM和CPU；其特征在于，所述CPU控制所述流量池对输入的基因组进行测序；所述流量池将所述基因组测序为电信号并写入所述DRAM；所述CPU获取所述DRAM中的所述电信号，利用CPU中的高速缓存内碱基识别架构进行碱基识别；其中，所述高速缓存内碱基识别架构包括碱基识别控制器和碱基识别缓存；所述碱基识别控制器接收并解析CPU内核的指令，在该指令指示执行加速模式的情况下，根据预配置的分区表，选择所述碱基识别缓存中相应的缓存阵列来执行碱基识别计算。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 中科计算技术西部研究院 一种加速碱基识别的测序和分析系统及碱基识别装置
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