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申请/专利权人：天津华大医学检验所有限公司;深圳华大基因股份有限公司
申请日：2021-12-29
公开（公告）日：2024-05-17
公开（公告）号：CN118056133A
主分类号：G01N33/574
分类号：G01N33/574
优先权：
专利状态码：在审-实质审查的生效
法律状态：2024.06.04#实质审查的生效;2024.05.17#公开
摘要：一种评估肿瘤免疫微环境的评分模型及其构建方法，涉及生物信息领域。利用该方法构建获得的评分模型，全面衡量了肿瘤微环境免疫组分的程度，该模型着眼于各种免疫细胞组分与平均水平的差异，将难以叠加的差异水平转化为概率模型，解决了浸润水平量纲不统一的难题。
主权项：一种用于评估肿瘤免疫微环境的评分模型的构建方法，其中，所述方法包括：1收集数据，所述数据包括分析数据集，其中，所述分析数据集包括多个癌种的转录组测序数据，每个癌种包括多个样本；2计算所述分析数据集中每个样本中每一种免疫细胞类型组分的浸润得分；3利用步骤2获得的所述每一种免疫细胞类型组分的浸润得分确定相应免疫细胞类型组分得分的分布区间，获得肿瘤浸润免疫细胞组分概率分布；4利用所述肿瘤浸润免疫细胞组分概率分布，针对所述分析数据集中每个样本的每一种细胞类型，计算对免疫组分的贡献度，构建用于评估肿瘤免疫微环境的评分模型，所述评分模型为：ICS＝-Σlog 2p cell_i其中，所述p cell_i代表所述样本中属于免疫组分的一类细胞组分得分出现的概率，i表示细胞种类，所述ICS为所述样本中属于免疫细胞组分的一类细胞对免疫组分的贡献度。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 天津华大医学检验所有限公司;深圳华大基因股份有限公司 评估肿瘤免疫微环境的评分模型及其构建方法
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