申请/专利权人：清华大学

申请日：2022-10-21

公开（公告）日：2023-06-20

公开（公告）号：CN115662500B

主分类号：G16B15/20

分类号：G16B15/20;G16B40/10

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2023.06.20#授权;2023.02.17#实质审查的生效;2023.01.31#公开

摘要：本发明公开了通过计算机模拟替换相近质量同位素区分聚糖结构异构体的方法。所述方法通过计算机模拟使用相似质量同位素替换待定量的聚糖异构体的结构异构体中的同位素，得到化学式和质量发生微调改变质量差小于0.2Da的模拟聚糖异构体，同时基于质谱数据可对模拟后获得的结构异构体进行定量。实验证明，通过本发明所建立的方法对肝癌患者血清与正常人血清中鉴定得到的1218条糖肽中聚糖异构体的结构异构体进行区分和定量，最终糖肽无缺失值且获得315条糖肽在肝癌与正常人血清中的改变大于2.5倍。因此本发明所建立的方法可以有效地区分不同糖肽链接糖异构体，并且准确地无缺失值地对鉴定得到的糖肽均进行定量和差异分析。

主权项：1.基于质谱数据对聚糖异构体进行定量分析的方法，其特征在于：所述方法包括如下步骤：通过计算机模拟使用相似质量同位素替换待定量的聚糖异构体的结构异构体中的同位素，得到化学式和质量发生改变的模拟聚糖异构体；基于质谱数据对所述模拟聚糖异构体进行定量，得到不同结构异构体的定量结果；所述模拟聚糖异构体的质量与所述待定量的聚糖异构体的质量的差值小于等于0.2Da；以x为所述待定量的聚糖异构体中的每个结构异构体按照glycanID号从小到大排序后的序号，所述序号是一个自然数，所述排序从1开始连续计数至n；所述计算机模拟根据所述待定量聚糖异构体的化学式中N和O的数量进行模拟，包括如下步骤或如下任一步骤：A1所述化学式中N的数量m大于或等于所述聚糖异构体的结构异构体的数量减1，对于排序序号为x的结构异构体，在化学式中去掉x-1个14N，增加x-1个13C及x-1个1H得到所述模拟聚糖异构体，与所述待定量聚糖异构体相比，所述模拟聚糖异构体的质量增加x-1×0.008106Da；A2所述化学式中N的数量m小于所述聚糖异构体的结构异构体的数量减1，但是N的数量m和O的数量k之和m+k大于或等于所述结构异构体的数量减1，对于排序序号为x的结构异构体，在化学式中去掉x-1个14N，增加x-1个13C及x-1个1H，直至去掉m个14N；然后对于排序序号为x的结构异构体，在化学式中去掉m个14N，增加m个13C及m个1H，并且在化学式中去掉x-m-1个16O，增加x-m-1个15N和x-m-1个1H得到所述模拟聚糖异构体，与所述待定量聚糖异构体相比，所述模拟聚糖异构体的质量增加x-1×0.008106Da或m×0.008106Da+x-m-1×0.013019Da；A3所述化学式中N的数量m和O的数量k之和m+k小于所述聚糖异构体的结构异构体的数量减1，对于排序序号为x的结构异构体，在化学式中去掉x-1个14N，增加x-1个13C及x-1个1H，直至去掉m个14N；然后对于排序序号为x的结构异构体，在化学式中去掉m个14N，增加m个13C及m个1H，并且在化学式中去掉x-m-1个16O，增加x-m-1个15N和x-m-1个1H，直至去掉k个16O；再然后对于排序序号为x的结构异构体，在化学式中去掉m个14N，增加m个13C及m个1H，并且在化学式中去掉x-m-1个16O，增加x-m-1个15N和x-m-1个1H，在化学式中去掉x-m-k-1个12C及x-m-k-1个1H，增加x-m-k-1个15N得到所述模拟聚糖异构体，与所述待定量聚糖异构体相比，所述模拟聚糖异构体的质量增加x-1×0.008106Da或m×0.008106Da+x-m-1×0.013019Da或m×0.008106Da+k×0.013019Da+x-m-k-1×0.0233Da；所述待定量的聚糖异构体包含n个结构异构体，n为自然数；m为自然数；k为自然数。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 清华大学 通过计算机模拟替换相近质量同位素区分聚糖结构异构体的方法

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