申请/专利权人：苏州科锐迈德生物医药科技有限公司

申请日：2021-01-18

公开（公告）日：2023-12-26

公开（公告）号：CN112735525B

主分类号：G16B30/00

分类号：G16B30/00;G16B20/00;G16B50/40

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2023.12.26#授权;2021.05.21#实质审查的生效;2021.04.30#公开

摘要：本申请涉及一种基于分治法的mRNA序列优化的方法和装置，采用分治法对mRNA序列优化，通过在每次合并后均检查是否有发夹结构生成以及是否具有影响蛋白表达的因素，能够保证优化的mRNA序列不具有上述影响表达的因素，生成序列结构稳定，优化序列表达效率高。同时采用的分治法具有优化速度快，可进行批量序列优化的特点。

主权项：1.一种基于分治法的mRNA序列优化的方法，其特征在于，包括以下步骤：S1:获取一段待优化的mRNA序列，截取蛋白质编码区，并且获取mRNA序列来源物种的相同蛋白质对应的密码子的使用频率；S2:将mRNA序列连续均分若干次，最终均分得到仅含有1个密码子的序列片段；S3:将表达为相同蛋白质的密码子统一替换成S1步骤中使用频率最高的密码子；S4:逆向操作均分过程，从2个密码子开始进行合并直至合并形成与待优化的mRNA序列相同的长度，每次合并均检查是否有发夹结构生成以及是否具有影响蛋白表达的因素，若没有发夹结构和影响蛋白表达的因素则进入下一次合并，否则则将发夹结构处或者影响蛋白表达的因素处的密码子替换成与替换前的密码子相比使用频率更小的密码子；S5:以S4步骤确定的mRNA序列作为优化后的mRNA序列。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 苏州科锐迈德生物医药科技有限公司 一种基于分治法的mRNA序列优化的方法与装置

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