申请/专利权人：安徽大学

申请日：2022-06-15

公开（公告）日：2024-03-08

公开（公告）号：CN115063794B

主分类号：G06V20/69

分类号：G06V20/69;G06V20/64;G06V10/75

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.03.08#授权;2022.10.04#实质审查的生效;2022.09.16#公开

摘要：本发明提出了一种秀丽隐杆线虫全身细胞自动识别的方法，通过基于秀丽隐杆线虫数据集构建包含细胞位置信息和拓扑结构信息的统计学图谱；其中，图谱包含平均空间位置ASP、空间位置方差SLV、拓扑结构方差TSV；获得细胞中心位置，通过人工标注或者自动分割细胞获得测试样本线虫中细胞质心位置；基于点集配准获得细胞位置和图谱的初始匹配关系；并基于统计图谱迭代优化细胞位置与图谱的匹配关系；基于图谱中已知的细胞身份通过匹配关系自动识别细胞。通过构件秀丽隐杆线虫全身细胞统计学图谱，基于包含细胞位置和拓扑结构等多种先验信息的统计学图谱实现了线虫全身细胞的自动识别。

主权项：1.一种秀丽隐杆线虫全身细胞自动识别的方法,其特征在于，所述方法包括：S1，基于秀丽隐杆线虫数据集构建包含细胞位置信息和拓扑结构信息的统计学图谱；其中，图谱包含平均空间位置ASP、空间位置方差SLV、拓扑结构方差TSV；所述S1还包括：ASP的生成方法、SLV的生成方法以及TSV的生成方法；其中，ASP的生成方法，包括：S101，选择一个任意的线虫细胞位置作为初始ASP，其余的线虫细胞使用三维仿射变换全局地与初始ASP对齐，然后平均在一起，得到新的ASP；S102，计算所有样本的平均形变场，使用平均形变场的逆形变场对S101中创建的新的ASP进行形变；S103，回到步骤S101，用步骤S102中形变后的ASP替换初始ASP，继续迭代，直到ASP收敛到稳定状态；S104，使用分段仿射变换将每个线虫的细胞映射到ASP上，并对结果进行平均，生成最终的ASP；所述SLV的生成方法，包括：在ASP的制作方法中步骤S104中分段仿射结果上，计算每个细胞位置沿X、Y和Z方向的标准偏差作为SLV；所述TSV的生成方法，包括：分别获得在ASP的制作方法中步骤S104中分段仿射结果以及ASP上的每个细胞的形状上下文特征，然后计算ASP中细胞相应位置的形状上下文特征的标准偏差，作为TSV；S2，获得细胞中心位置，通过人工标注或者自动分割细胞获得测试样本线虫中细胞质心位置；S3，基于点集配准获得细胞位置和图谱的初始匹配关系；并基于统计图谱迭代优化细胞位置与图谱的匹配关系；S4，基于图谱中已知的细胞身份通过匹配关系自动识别细胞。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 安徽大学 一种秀丽隐杆线虫全身细胞自动识别的方法

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