申请/专利权人：北京大学第三医院(北京大学第三临床医学院)

申请日：2024-02-07

公开（公告）日：2024-03-19

公开（公告）号：CN117721222A

主分类号：C12Q1/6888

分类号：C12Q1/6888;C12Q1/6869;G16B25/10;G16B30/10

优先权：

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2024.04.05#实质审查的生效;2024.03.19#公开

摘要：本发明涉及医药检测领域，具体涉及一种单细胞转录组预测胚胎着床的方法及应用。所述单细胞转录组预测胚胎着床的方法，主要通过两步实现对胚胎着床潜能的预测：第一是发育潜能初步评估，即确定着床成功与着床失败的胚胎在转录组整体水平上的差异的规律，然后根据这个规律，将临床上的胚胎分为“高发育潜能组”和“低发育潜能组”；第二是发育异常的胚胎的排查，即根据染色体表达量的分布划分阈值，将染色体分为“正常表达”与“异常表达”染色体，含有“异常表达”染色体的胚胎被认为是发育异常的胚胎；可见，“高发育潜能组”中不含有“异常表达”染色体的胚胎被认为是能成功着床的胚胎。

主权项：1.一种单细胞转录组预测胚胎着床的方法，其特征在于，包括如下步骤：S1：对胚胎发育潜能初步评估；S2:对发育异常的胚胎的排查；所述S1步骤包括如下步骤：（1）活检获得囊胚外滋养层细胞，进行单细胞转录组测序；（2）对测序数据清洗、比对及比对后处理；（3）对测序后的样本进行筛选，并生成基因表达矩阵；（4）制作人类正常二倍体胚胎基因表达参考系；（5）制作相对表达量矩阵，（6）生成以染色体为单位的相对表达矩阵；（7）确定染色体表达量正常和染色体表达量异常的划分阈值，并识别出异常表达的染色体；（8）用移植过的临床样本来确定着床成功组与着床失败组在总表达量上的区别，再根据总表达量与染色体表达量评估胚胎发育潜能；所述S2步骤包括如下步骤：a：选取胚胎的囊胚期滋养层细胞的转录组数据为临床样本；b：生成用于计算表达参考系的基因表达矩阵；c:制作人类正常二倍体胚胎基因表达参考系；d：制作相对表达量矩阵；e：生成以染色体为单位的相对表达矩阵f：用上述S1步骤中的步骤（7）所计算的阈值，判断临床样本的染色体表达异常情况；g：将胚胎样本的整体基因表达量按照大小排序，根据总表达量上的排序，区别高发育潜能组与低发育潜能组；h：根据染色体表达情况和着床潜能评估，预测胚胎的着床结果；根据样本预测情况，结合临床需求，挑选了被预测为成功的样本进行临床移植。

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权利要求：

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