申请/专利权人：上海国际旅行卫生保健中心(上海海关口岸门诊部)

申请日：2020-12-29

公开（公告）日：2024-03-22

公开（公告）号：CN112481402B

主分类号：C12Q1/689

分类号：C12Q1/689;C12Q1/6858;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/32

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.03.22#授权;2021.03.30#实质审查的生效;2021.03.12#公开

摘要：本发明提供了一种基于Sanger测序的结核分枝杆菌MLST分型检测用引物组及其应用，属于微生物基因分型技术领域。本发明以gyrA基因片段、rpoB基因片段、pks5基因片段、Rv2295基因片段、mbtF基因片段、leuB基因片段和embB基因片段串联构建MLST基因的系统发育树，能把25个不同来源的结核分枝杆菌样本全部区分开；同时采用上述各基因的引物对结核分枝杆菌样本进行PCR扩增，扩增的各基因片段通过与分型库比对，结果表明，所有检测样本均能够得到唯一的基因型和总的菌株ST型。说明该引物组达到对结核分枝杆菌准确分型的目的。因此，该引物组能够用于结核分枝杆菌MLST分型与溯源中。

主权项：1.一种基于Sanger测序的结核分枝杆菌MLST分型检测用引物组，其特征在于，包括gyrA基因扩增引物、rpoB基因扩增引物、pks5基因扩增引物、Rv2295基因扩增引物、mbtF基因扩增引物、leuB基因扩增引物和embB基因扩增引物；所述gyrA基因扩增引物包括核苷酸序列如SEQIDNO：1所示的正向引物和核苷酸序列如SEQIDNO：2所示的反向引物；所述rpoB基因扩增引物包括核苷酸序列如SEQIDNO：3所示的正向引物和核苷酸序列如SEQIDNO：4所示的反向引物；所述pks5基因扩增引物包括核苷酸序列如SEQIDNO：5所示的正向引物和核苷酸序列如SEQIDNO：6所示的反向引物；所述Rv2295基因扩增引物包括核苷酸序列如SEQIDNO：7所示的正向引物和核苷酸序列如SEQIDNO：8所示的反向引物；所述mbtF基因扩增引物包括核苷酸序列如SEQIDNO：9所示的正向引物和核苷酸序列如SEQIDNO：10所示的反向引物；所述leuB基因扩增引物包括核苷酸序列如SEQIDNO：11所示的正向引物和核苷酸序列如SEQIDNO：12所示的反向引物；所述embB基因扩增引物包括核苷酸序列如SEQIDNO：13所示的正向引物和核苷酸序列如SEQIDNO：14所示的反向引物。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 上海国际旅行卫生保健中心(上海海关口岸门诊部) 一种基于Sanger测序的结核分枝杆菌MLST分型检测用引物组及其应用

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