申请/专利权人:中国热带农业科学院三亚研究院
申请日:2023-12-26
公开(公告)日:2024-03-26
公开(公告)号:CN117448470B
主分类号:C12Q1/689
分类号:C12Q1/689;C12Q1/6844;C12N15/11;C12R1/01
优先权:
专利状态码:有效-授权
法律状态:2024.03.26#授权;2024.02.13#实质审查的生效;2024.01.26#公开
摘要:本发明提供一种快速共检水稻白叶枯病菌和细菌性条斑病菌的序列组合及其应用,属于病原微生物检测技术领域,提供了一种快速共检水稻白叶枯病菌和细菌性条斑病菌的LAMP引物对、crRNA和ssDNA探针的序列组合,还提供了一种基于CRISPRCas12a‑LAMP快速共检水稻白叶枯病菌和细菌性条斑病菌的试剂盒、检测方法和应用。本发明的检测方法将LAMP扩增方法与CRISPRCas12a的检测方法结合来共检水稻白叶枯病菌和细菌性条斑病菌,通过蓝光切胶仪和侧流层析试纸条实现可视化检测;本发明的检测方法具有良好的特异性、敏感性、只需要简单的仪器便可以进行检测,具有快速检测的优势。
主权项:1.一种基于CRISPRCas12a-LAMP快速共检水稻白叶枯病菌和细菌性条斑病菌的序列组合物,其特征在于,包括根据acnD基因设计的LAMP引物对序列、crRNA序列和ssDNA探针序列;其中,所述的LAMP引物对序列为:上游外引物acnD-LAMP-F3的序列如SEQIDNO:1所示;下游外引物acnD-LAMP-B3的序列如SEQIDNO:2所示;上游内外引物acnD-LAMP-FIP的序列如SEQIDNO:3所示;下游内引物acnD-LAMP-BIP的序列如SEQIDNO:4所示;上游环状引物acnD-LAMP-LF的序列如SEQIDNO:5所示;下游环状引物acnD-LAMP-LB的序列如SEQIDNO:6所示;所述的crRNA的序列如SEQIDNO:7所示;所述的ssDNA探针序列是用于荧光定量PCR检测反应的ssDNA探针序列、用于可视化荧光检测反应的ssDNA探针序列或用于侧流层析试纸条的ssDNA探针序列;所述的用于荧光定量PCR检测反应的ssDNA探针序列为ssDNA-reporter-FAM或ssDNA-reporter-CY5;其中,所述的ssDNA-reporter-FAM为:5’-FAM-TTATT-BHQ1-3’;所述的ssDNA-reporter-CY5为:5’-CY5-TGTCTTATcccccATAAGACA-BHQ1-3’;所述的用于可视化荧光检测反应的ssDNA探针序列为ssDNA-reporter-FAM-2:5’-FAM-TGTCTTATcccccATAAGACA-BHQ1-3’;所述的用于侧流层析试纸条的ssDNA探针序列为FB-reporter:5’-FAM-TTTTTTTTT-Biotin-3’。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 中国热带农业科学院三亚研究院 一种快速共检水稻白叶枯病菌和细菌性条斑病菌的序列组合及其应用
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