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【发明公布】药物靶点蛋白相互作用识别方法、装置、设备及存储介质_国药(武汉)精准医疗科技有限公司;国药集团基因科技有限公司;国药(武汉)医学实验室有限公司_202311814450.X 

申请/专利权人:国药(武汉)精准医疗科技有限公司;国药集团基因科技有限公司;国药(武汉)医学实验室有限公司

申请日:2023-12-26

公开(公告)日:2024-04-02

公开(公告)号:CN117809737A

主分类号:G16B15/30

分类号:G16B15/30;G06F18/213;G06F18/25;G06F18/241

优先权:

专利状态码:在审-实质审查的生效

法律状态:2024.04.19#实质审查的生效;2024.04.02#公开

摘要:本申请涉及一种药物靶点蛋白相互作用识别方法、装置、设备以及存储介质。所述方法包括:对药物靶点蛋白相互作用数据集中的药物进行SMILES字符串和摩根指纹提取,并获取药物靶点蛋白相互作用数据集中蛋白质对应的氨基酸序列以及PSSM矩阵;对SMILES字符串和摩根指纹进行药物特征提取,并对氨基酸序列和PSSM矩阵进行蛋白质特征提取,得到第一特征图和第二特征图;将第一特征图和第二特征图输入特征融合网络,特征融合网络对第一特征图和第二特征图进行融合后,输出药物靶点蛋白相互作用关系的分类预测结果。本申请通过采用多头注意力机制,能够捕捉输入特征图之间的复杂关联,提高药物靶点蛋白相互作用的预测能力。

主权项:1.一种药物靶点蛋白相互作用识别方法,其特征在于,包括:收集药物靶点蛋白相互作用数据集,对所述药物靶点蛋白相互作用数据集中的药物进行SMILES字符串和摩根指纹提取,并获取所述药物靶点蛋白相互作用数据集中蛋白质对应的氨基酸序列以及PSSM矩阵;对所述SMILES字符串和摩根指纹进行药物特征提取,并对所述氨基酸序列和PSSM矩阵进行蛋白质特征提取,得到第一特征图和第二特征图,其中,所述第一特征图为药物特征图,所述第二特征图为蛋白质特征图;将所述第一特征图和第二特征图输入训练好的特征融合网络,所述特征融合网络采用多头注意力机制对所述第一特征图和第二特征图进行融合后,输出药物靶点蛋白相互作用关系的分类预测结果。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 国药(武汉)精准医疗科技有限公司;国药集团基因科技有限公司;国药(武汉)医学实验室有限公司 药物靶点蛋白相互作用识别方法、装置、设备及存储介质

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