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【发明公布】一种智能识别化学不稳定天然产物的方法和系统_中国科学院上海有机化学研究所_202410052842.5 

申请/专利权人:中国科学院上海有机化学研究所

申请日:2024-01-15

公开(公告)日:2024-04-09

公开(公告)号:CN117854635A

主分类号:G16C20/70

分类号:G16C20/70;G16C20/80;G16C20/10

优先权:

专利状态码:在审-实质审查的生效

法律状态:2024.04.26#实质审查的生效;2024.04.09#公开

摘要:本发明公开了一种智能识别化学不稳定天然产物的方法和系统,所述方法包括:构建天然产物反应活性结构特征表,遍历读取天然产物反应活性结构特征表中的所有活性结构特征的SMILES数据、并一一与所输入的表达天然产物化学结构的SMILES数据进行比对,识别出其中是否含有已知的活性结构特征并输出识别结果。本发明能快速识别所研究的天然产物在实验过程中的化学不稳定性,并能给予相关实验风险因素的提示,识别结果可作为研究人员对天然产物化学稳定性的判断依据,可避免重复实验从而降低实验成本,保证了后续实验精确性和高效率,尤其是,本发明还可对化学不稳定天然产物的原始化学结构进行科学预测,对促进天然产物的研究具有重要价值。

主权项:1.一种智能识别化学不稳定天然产物的方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:S1输入构建的天然产物反应活性结构特征表和表达天然产物化学结构的SMILES数据,所述的天然产物反应活性结构特征表中包括:若干活性结构特征的SMILES数据,每个活性结构特征所对应的原始结构的SMILES数据,每个活性结构特征所对应的特征名称,表示每个活性结构特征中的重原子数量的特征大小,表示每个活性结构特征活性反应类型的特征类型,诱发每个活性结构特征发生活性反应的风险因素;S2使用RDKit工具中的“MolFromSmiles”函数依次读取天然产物反应活性结构特征表中的活性结构特征的SMILES数据,并使用RDKit工具中的“HasSubstructMatch”函数比对每次所读取的活性结构特征的SMILES数据与所输入的表达天然产物化学结构的SMILES数据,若函数输出为“True”,则标记该次读取的活性结构特征为“有”;若函数输出为“False”,则标记该次读取的活性结构特征为“无”;S3当按步骤S2对天然产物反应活性结构特征表中的所有活性结构特征的SMILES数据均遍历完读取和比对后,若比对结果均为“无”,则输出“识别完成”,并提示“所输入的天然产物的化学不稳定性未知”;否则,输出所有标记为“有”的活性结构特征的SMILES数据及其在天然产物反应活性结构特征表中所对应的其它信息。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 中国科学院上海有机化学研究所 一种智能识别化学不稳定天然产物的方法和系统

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