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【发明公布】液相色谱-质谱法或液相色谱法检测RNA中N1-甲基-假尿苷修饰丰度的方法_中国农业科学院生物技术研究所_202311810281.2 

申请/专利权人:中国农业科学院生物技术研究所

申请日:2023-12-26

公开(公告)日:2024-04-05

公开(公告)号:CN117825589A

主分类号:G01N30/06

分类号:G01N30/06;G01N30/34;G01N30/60;G01N30/72

优先权:

专利状态码:在审-实质审查的生效

法律状态:2024.04.23#实质审查的生效;2024.04.05#公开

摘要:本发明公开了液相色谱‑质谱法或液相色谱法检测RNA中N1‑甲基‑假尿苷修饰丰度的方法。液相色谱‑质谱法检测RNA中N1‑甲基‑假尿苷修饰丰度的方法包括如下步骤:S1、提取生物样本的RNA,进行单核苷酸制备,再去磷酸化,纯化单核苷酸,得到上机样本;S2、进行液相色谱‑质谱法检测,采用外标法对所述上机样本中的N1‑甲基‑假尿苷含量和尿嘧啶核糖核苷含量分别进行定量,以N1‑甲基‑假尿苷含量除以尿嘧啶核糖核苷含量,获得所述生物样本的RNA中N1‑甲基‑假尿苷修饰丰度。本发明首次在RNA上准确检测出了N1‑甲基‑假尿苷,并且准确定量了植物中N1‑甲基‑假尿苷修饰丰度。

主权项:1.液相色谱-质谱法检测RNA中N1-甲基-假尿苷修饰丰度的方法,其特征在于:包括如下步骤:S1、提取生物样本的RNA,进行单核苷酸制备,进一步去磷酸化,然后纯化单核苷酸,得到上机样本;S2、进行液相色谱-质谱法检测,采用外标法对所述上机样本中的N1-甲基-假尿苷含量和尿嘧啶核糖核苷含量分别进行定量,以N1-甲基-假尿苷含量除以尿嘧啶核糖核苷含量,获得所述生物样本的RNA中N1-甲基-假尿苷核苷修饰丰度;所述N1-甲基-假尿苷含量根据在碰撞能量为5V,mz为259.2-223的离子峰、碰撞能量为10V,mz为259.2-138.9的离子峰和碰撞能量为25V,mz为259.2-95.9的离子峰对应的色谱峰进行定量;所述尿嘧啶核糖核苷含量根据在碰撞能量为35V,mz为245.1-69.9的离子峰对应的色谱峰进行定量。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 中国农业科学院生物技术研究所 液相色谱-质谱法或液相色谱法检测RNA中N1-甲基-假尿苷修饰丰度的方法

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