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【发明授权】一种飞行时间质谱峰拟合方法_浙江迪谱诊断技术有限公司_202111610029.8 

申请/专利权人:浙江迪谱诊断技术有限公司

申请日:2021-12-27

公开(公告)日:2024-04-12

公开(公告)号:CN114487072B

主分类号:G01N27/62

分类号:G01N27/62;G06F17/15

优先权:

专利状态码:有效-授权

法律状态:2024.04.12#授权;2024.03.26#著录事项变更;2022.05.31#实质审查的生效;2022.05.13#公开

摘要:本发明公开了一种飞行时间质谱峰拟合方法,包括:将整条飞行时间核酸质谱图按照一定间隔长度进行分段,并计算出各分段强度阈值和二阶导数阈值:在每个分段内找到离子强度过零点的一阶导数,确定可能的高斯峰位置;从可能的高斯峰位置中,选取符合条件的离子强度,得到确定的高斯峰位置,确定出所有的高斯峰个数l,及高斯峰的质荷比mzi和峰高Hi;根据半经验公式,计算得到高斯峰的峰宽Wi;将高斯峰的质荷比mzi和峰宽Wi,取4Wi作为高斯拟合区域,作为高斯峰最小二乘法迭代初始值;将高斯拟合区域4Wi内的所有采样点的核酸质谱数据带入高斯拟合函数fxi中进行迭代求解,得到精确的拟合高斯峰的质荷比mzfit、峰宽Wfit、峰高Hfit。

主权项:1.一种飞行时间质谱峰拟合方法,其特征在于:包括以下步骤:步骤1:获取整条飞行时间核酸质谱图,该飞行时间核酸质谱图,以采样点的质荷比为横坐标,以采样点的离子强度为纵坐标;对于第i个采样点,i∈{1,2,3,…,n},其核酸质谱数据表示为Ii,mzi,其中,Ii表示离子强度,mzi表示质荷比;步骤2:将整条飞行时间核酸质谱图按照一定间隔长度进行分段,并计算出各分段强度阈值和二阶导数阈值,对于第j分段,其强度阈值表示为Ithresholdj和二阶导数阈值表示为I″thresholdj:对于第j分段,按照下式计算强度阈值Ithresholdj和二阶导数阈值I″thresholdj: 式中,为第j分段内离子强度的平均值,σj为第j分段内离子强度的标准差;a为信号强度阈值系数,a∈{1,2,3};d为特定系数,取值为2,Hj和Wj为第j分段内峰高最小的特征峰的峰高和半高半宽;步骤3:在每个分段内找到离子强度过零点的一阶导数,该一阶导数对应的原始的质荷比,为可能的高斯峰位置;步骤4:从可能的高斯峰位置中,选取符合以下条件的离子强度,该离子强度对应的原始的质荷比,为确定的高斯峰位置: 式中,I′i+1j为第j分段内第i+1采样点的离子强度Ii+1j的一阶导数I′i+1j;确定出所有的高斯峰个数l,及高斯峰的质荷比mzi和峰高Hi,峰高Hi由以下公式计算得到:对于第i个采样点,当质谱基线ci为零,峰高Hi=Ii;当质谱基线ci不为零,峰高Hi=Ii-ci;步骤5:根据半经验公式,计算得到高斯峰的峰宽Wi=2×0.001×mzi;步骤6:将高斯峰的质荷比mzi和峰宽Wi,取4Wi作为高斯拟合区域,作为高斯峰最小二乘法迭代初始值;步骤7:将高斯拟合区域4Wi内的所有采样点的核酸质谱数据带入高斯拟合函数fxi中进行迭代求解: 其中,Hfit、mzfit、Wfit分别为拟合高斯峰的峰高、质荷比和峰宽,α为特征峰宽系数,取值为0.60056120439323;质谱基线cfit根据下式进行求解:cfit=A\I9其中,I为由高斯拟合区域内所有采样点的离子强度Ii组成的向量,表示为I=I1,I2,I3,…,IN,N为高斯拟合区域内所有采样点的总数,A为向量内部所有数值均为1且长度与向量I相同,表示为A=11,12,13,…,1N;将求解得到的拟合高斯峰的峰高Hfit和质荷比mzfit与作为迭代初始值的质荷比mzi和峰高Hi进行匹配,判断以下条件是否成立: 式中,为第k次和第k+1次迭代拟合求解得到的质荷比,k为大于1的正整数,Δ1、Δ2和Δ3为微小量常数;若不成立,则将拟合高斯峰的峰高Hfit和质荷比mzfit作为下一次迭代初始值,进行新一轮的求解直到满足式10的条件;若成立,则拟合求解结束,得到精确的拟合高斯峰的质荷比mzfit、峰宽Wfit、峰高Hfit。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 浙江迪谱诊断技术有限公司 一种飞行时间质谱峰拟合方法

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