申请/专利权人：圆方基因科技(北京)有限公司

申请日：2021-08-06

公开（公告）日：2024-04-23

公开（公告）号：CN113764041B

主分类号：G16B30/00

分类号：G16B30/00;G16B20/00

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.04.23#授权;2021.12.24#实质审查的生效;2021.12.07#公开

摘要：本发明公开了一种物种基因识别标签的查找方法、装置及电子设备，其中方法包括：S1：将目标物种在序列名称总核酸库中检索比对，获取目标物种的物种信息；S2：根据核酸序列和物种分类地位及名称进行比对，得到第一比对结果；S3：将第一比对结果进行分类，形成各范围序列相似度对应的片段池，将范围序列相似度对应的片段池与序列名称总核酸库进行Blastn比对，得到第二比对结果；S4：对第二比对结果进行自动质控，获取物种特征标签，并将物种特征标签与名称片段标记库进行Blastn比对，得到目标物种的第一识别标签和第一识别阈值。本发明将识别标签与识别阈值结合，有效增加了物种鉴定的种内和种间识别的范围和准确度；自动进行分析和计算，节省人力。

主权项：1.一种物种基因识别标签的查找方法，其特征在于，包括：S1：接收输入的目标物种，并将所述目标物种在序列名称总核酸库中检索比对，获取所述目标物种的物种信息，所述物种信息包括核酸序列、物种分类地位及名称；S2：根据所述核酸序列和物种分类地位及名称进行比对，得到第一比对结果；根据所述物种分类地位及名称，从所述序列名称总核酸库中抽取目标物种所在属的序列和名称，形成目标物种所在属序列池；将所述核酸序列进行K-mer切分，形成各K值对应的片段池，并从K值对应的片段池提取名称片段标记库；基于配置的第一综合阈值，将K值对应的片段池与所述目标物种所在属序列池进行Blastn比对，得到第一比对结果；其中，所述第一综合阈值包括：比对长度为100％、序列相似度不高于95％、比对得分不低于1e-5；S3：按照序列相似度所处范围将所述第一比对结果进行分类，形成各范围序列相似度对应的片段池，并将范围序列相似度对应的片段池与所述序列名称总核酸库进行Blastn比对，得到第二比对结果；S4：基于配置的剔除序列控制指标对所述第二比对结果进行自动质控，获取物种特征标签，并将所述物种特征标签与名称片段标记库进行Blastn比对，得到目标物种的第一识别标签和第一识别阈值。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 圆方基因科技(北京)有限公司 物种基因识别标签的查找方法、装置及电子设备

免责声明
1、本报告根据公开、合法渠道获得相关数据和信息，力求客观、公正，但并不保证数据的最终完整性和准确性。
2、报告中的分析和结论仅反映本公司于发布本报告当日的职业理解，仅供参考使用，不能作为本公司承担任何法律责任的依据或者凭证。

阅读全文 双屏查看 官方信息 专利公告 收藏专利 下载PDF 下载WORD