申请/专利权人:中国科学技术大学
申请日:2024-01-30
公开(公告)日:2024-04-26
公开(公告)号:CN117925801A
主分类号:C12Q1/6869
分类号:C12Q1/6869;G16B30/10;G16B25/10;C12Q1/6893;C12N15/53;C12N15/54
优先权:
专利状态码:在审-实质审查的生效
法律状态:2024.05.14#实质审查的生效;2024.04.26#公开
摘要:本发明提供分析嗜热四膜虫镉耐受机制关联基因的方法,所述方法包括以下步骤:a.在含镉环境中培养嗜热四膜虫;b.提取培养的嗜热四膜虫的RNA,构建cDNA文库进行高通量测序;c.对测序数据进行质控;d.将质控后的测序数据与参考基因组比对并进行基因表达水平定量;e.筛选差异表达基因或进行转录组时序分析,对不同表达变化趋势的基因进行聚类;f.采用KEGG和GO数据库分别进行通路富集分析和功能富集分析,获得嗜热四膜虫在时间序列上响应镉胁迫相关代谢通路的动态变化,进而选取代谢通路相关的表达差异显著的基因作为潜在的嗜热四膜虫镉耐受机制关联基因。
主权项:1.分析嗜热四膜虫镉耐受机制关联基因的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:a.在含镉环境中培养嗜热四膜虫;b.提取培养的嗜热四膜虫的RNA,构建cDNA文库进行高通量测序;c.对测序数据进行质控;d.将质控后的测序数据与参考基因组比对并进行基因表达水平定量;e.筛选差异表达基因或进行转录组时序分析,对不同表达变化趋势的基因进行聚类;f.采用KEGG和GO数据库分别进行通路富集分析释和功能富集分析,获得嗜热四膜虫在时间序列上响应镉胁迫相关代谢通路的动态变化,进而选取代谢通路相关的表达差异显著的基因作为潜在的嗜热四膜虫镉耐受机制关联基因。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 中国科学技术大学 分析嗜热四膜虫镉耐受机制关联基因的方法
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