申请/专利权人：中国医学科学院肿瘤医院

申请日：2023-01-19

公开（公告）日：2024-04-30

公开（公告）号：CN115982644B

主分类号：G06F18/241

分类号：G06F18/241;G06F18/23;G06F18/214;G16B25/10;G16B20/30

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.04.30#授权;2023.05.05#实质审查的生效;2023.04.18#公开

摘要：本发明公开了一种食管鳞状细胞癌分类模型构建与数据处理方法、系统、设备和计算机可读存储介质，方法其包括：获取训练集样本的测序数据及样本对应的生存期情况；从所述训练集样本的测序数据中提取DDR通路基因集及其基因表达情况；对所述DDR通路基因集进行选择处理，得到与生存率相关的通路，以及所述与生存率相关通路的基因表达情况；所述与生存率相关的通路包括以下一种或几种：MMR通路、NER通路、FA通路和NHEJ通路；基于所述生存期情况对所述训练集样本进行聚类分析，得到不同分类亚型及表征每组分类亚型的通路及其基因表达情况，得到分类模型。

主权项：1.一种食管鳞状细胞癌分类模型的构建方法，包括：获取训练集样本的测序数据及样本对应的生存期情况；从所述训练集样本的测序数据中提取DDR通路基因集及其基因表达情况；对所述DDR通路基因集进行选择处理，得到与生存率相关的通路，以及所述与生存率相关通路的基因表达情况；所述与生存率相关的通路包括以下一种或几种：MMR通路、NER通路、FA通路和NHEJ通路；基于所述与生存率相关通路的基因表达情况，利用单变量回归分析方法得到与生存结果相关的DDR基因集和对应基因表达情况；利用多变量分析方法对所述与生存结果相关的DDR基因集进行处理，得到预后预测基因和预后预测基因的基因表达情况；所述预后预测基因包括：BRCA1基因和HFM1基因；基于所述生存期情况对所述训练集样本进行聚类分析，得到不同分类亚型及表征每组分类亚型的预后预测基因及其基因表达情况，得到分类模型。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 中国医学科学院肿瘤医院 一种食管鳞状细胞癌分类模型构建与数据处理方法

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