申请/专利权人：重庆医科大学

申请日：2021-08-26

公开（公告）日：2024-05-17

公开（公告）号：CN113817814B

主分类号：C12Q1/6883

分类号：C12Q1/6883;G16B25/10;G16B30/00

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.05.17#授权;2022.01.07#实质审查的生效;2021.12.21#公开

摘要：本发明公开了一种人体免疫力定量评估系统，包括血液处理单元，用于从人外周血中分离得到免疫细胞；基因提取单元，用于提取总RNA；测序单元，用于对所提取的RNA进行高通量测序，得到基因表达的图谱；免疫评估单元，用于对基因表达进行加权评分计算，输出免疫力得分。本发明评估结果更全面，准确，对免疫力评价不再是临床上依靠经验而是定量化，此外本发明使分析结果能够模拟和预测真实结果，相对于其他传统的方法大大减少了人为因素的影响。

主权项：1.一种人体免疫力定量评估系统，其特征在于：包括血液处理单元，用于从人外周血中分离得到免疫细胞；基因提取单元，用于提取总RNA；测序单元，用于对所提取的RNA进行高通量测序，得到基因表达的图谱；免疫评估单元，用于对基因表达进行加权评分计算，输出免疫力得分，选取了23种免疫细胞亚型，对选取的各免疫细胞所对应的特征基因的基因表达进行加权评分计算，计算公式为n为此次免疫评估所选基因总的数量，Wi为基因平均权重，Ei为基因表达fpkm值，Refi为参照值，是表达量符合正态分布的正常人群某基因fpkm值的平均值；所述23种免疫细胞亚型包括嗜碱性粒细胞，嗜酸性粒细胞，嗜中性粒细胞，经典型单核细胞，中间型单核细胞，非经典型单核细胞，髓系DCs，pDCs，NKs，幼稚B细胞，记忆性B细胞，γδT细胞，黏膜相关恒定T细胞，幼稚CD4T细胞，记忆性CD4T细胞，幼稚CD8T细胞，记忆性CD8T细胞，滤泡辅助性T细胞，Th1型辅助T细胞，Th2型辅助T细胞，Th17型辅助T细胞，激活型CD4T细胞和激活型CD8T细胞；所述基因平均权重由所属的免疫细胞亚型确定，其中嗜碱性粒细胞的基因权重为0.005，嗜酸性粒细胞的基因权重为0.01，嗜中性粒细胞的基因权重为1，经典型单核细胞的基因权重为0.5，中间型单核细胞的基因权重为0.01，非经典型单核细胞的基因权重为0.05，髓系DCs的基因权重为0.5，pDCs的基因权重为0.5，NKs的基因权重为0.5，幼稚B细胞的基因权重为0.5，记忆性B细胞的基因权重为0.5，γδT细胞的基因权重为0.05，黏膜相关恒定T细胞的基因权重为0.05，幼稚CD4T细胞的基因权重为0.5，记忆性CD4T细胞的基因权重为0.1，幼稚CD8T细胞的基因权重为0.5，记忆性CD8T细胞的基因权重为0.1，滤泡辅助性T细胞的基因权重为0.5，Th1型辅助T细胞的基因权重为0.2，Th2型辅助T细胞的基因权重为0.2，Th17型辅助T细胞的基因权重为0.2，激活型CD4T细胞的基因权重为0.5和激活型CD8T细胞的基因权重为0.5；所述23种免疫细胞亚型所特有的特征基因包括：所述嗜碱性粒细胞的特征基因包括CPA3，MS4A3，HDC，MS4A2，IL4，GCSAML，GATA2，TPSAB1，CD200R1L，TEX101，SLC45A3，TRIM64B；所述嗜酸性粒细胞的特征基因包括CEBPE，SEMG1，ALOX15，CCL23，PRSS41，PRSS33，THBS4，FOXI1，SIGLEC8，EPX，SVOPL，FAM170B；所述嗜中性粒细胞的特征基因包括PI3，CHI3L1，CXCL8，ANXA3，CXCL1，TGM3，BTNL3，C4BPA，MMP9，MME，OTX1；所述经典型单核细胞的特征基因包括S1PR3，CCL13，PTGFR，CCL7，RXFP2，SPATA12，LGI2，CLEC5A，CCL8，TRPV4，CYP1B1，ADAMTS5，S100A8，S100A12，CD14，CD163，STAB1，CLEC4E，ASGR2，F13A1，CYP27A1；所述中间型单核细胞的特征基因包括PLPPR4，SYTL5，TNFSF18，PRTG，LYPD2，EPO，CABP4，L1TD1，KRT78，CKB，VMO1，DCSTAMP；所述非经典型单核细胞的特征基因包括CDKN1C，CLEC4F，NCF2,ACP5,PLA2G7,IGSF6,BCL2A1,BHLHE41,CXCL5,IL7R,C5AR1,AQP9,SLC15A3,ADAMDEC1,EGR2，PPP1R17，SFTPD，LYNX1，C1QB，CKB；所述髓系DCs的特征基因包括GPR31，ODF3L1，PRB2，CD207，CLEC14A，MRC1，EBLN1，CRIP3，CD1E，CRABP1，ADGRG6；所述pDCs的特征基因包括TPM2，LRRC26，ASIP，GPM6B，KRT5，NTM，SCT，SHD，KCNA5，SCARA5，EPHA2，MYMX；所述NKs的特征基因包括COX6A2，ZMAT4，KIR2DL4，EXOC1L，MAPK12，TTLL10，IL37，GHSR，BAALC，GPC6，C12orf71，EPS8L3，GZMB，KLRF1，KIR3DL1，KIR2DL1，NCAM1，KIR2DL3；所述幼稚B细胞的特征基因包括VPREB3，AC233755.1，IGLL5，COL19A1，PAX5，AC233755.2，AC141272.1，AC136616.2，WNT16，CPNE5，KLHL14，FMO1，SYN3，KCNG1，CRMP1，CXorf65，SPATA18，FOXD4L1，DAZL，GRB7，PRSS45，DSP，PTH2，MS4A1，CD22，CD19；所述记忆性B细胞的特征基因包括TAS1R3，AMPD1，FA2H，PPP1R37，TUBB2B，SAA4，PROX1，OR4C6，SDC1，EYA2，ARL14，TMEM74；所述γδT细胞的特征基因包括TMEM132C，GALNT18，FBXO39，NFASC，HNF4G，KRT84，CYP2C8，LIM2，GSC，TFCP2L1，KLKB1，MFAP2；所述黏膜相关恒定T细胞的特征基因包括DAB2IP，TUSC3，TBL1Y，FERMT2，NTN4，CFAP157，DUOXA1，PRSS35，TRPC3，ITPKA，ME1，SLC4A10；所述幼稚CD4T细胞的特征基因包括CAPN9，OR2T34，PHKA1，CAPSL，ALB，KRT72，SORCS3，FAM78B，GRIA3，WFDC10A，WFDC13，GYS2；所述记忆性CD4T细胞的特征基因包括IGFL2，SPACA6，KRTAP4-3，NDP，ADAM23，IL20RA，ART5，CYP4B1，PRY，NEFL；所述幼稚CD8T细胞的特征基因包括PRM3，SLC7A3，PCDHGB1，CFAP97D2，NDNF，GAP43，MXRA8，ZCCHC12，REG4，CD248，NRCAM，SFRP5；所述记忆性CD8T细胞的特征基因包括CH25H，OR4A47，NKX2-3，IRGC，IFNA21，OVOL1，OGDHL，NR2F2，PCDHB15，FAM180B，KRT74；所述滤泡辅助性T细胞的特征基因包括GAS6，HTR6，B4GALNT4，STK24-AS1，CLYBL-AS2，RPL7L1P12；所述Th1型辅助T细胞的特征基因包括PDE4D，SLC4A10，ADAM23，KIT，IL23R，TPBG，RBM24，SLC44A3，CHCHD2P8；所述Th2型辅助T细胞的特征基因包括SEMA5A，CHCHD3，KRT1，PKP2，AKAP12，CDO1，HPGDS，MRGPRD，CDH1，CLC；所述Th17型辅助T细胞的特征基因包括IL17RE，AIRE，CPNE7，NMU，DOCK9，TPTE2，BRD7，CLYBL；所述激活型CD4T细胞的特征基因包括CD40LG，IL2，CCL20，CD109，IL21，HCAR1，CLDN1，TNIP3；所述激活型CD8T细胞的特征基因包括CRTAM，LAYN，N4BP3，XCL1，CNIH2，SH2D5，AK4，CCDC173。

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